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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003952`

染色体: Chr05 坐标: 53249522-53250379 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003952`
名称	SmilChr05G003952
描述	uncharacterized mitochondrial protein AtMg00310-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	53249522 - 53250379 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026117`
GeneID	`131026117`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026117`
原始查询	`SmilChr05G003952`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=ATMG00310; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	hit=ATMG00310; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`ATMG00310` - identity=39.3; qcov=0.509; evalue=3.42e-35; confidence=medium
Rice	`Os01g0714225` - identity=47.5; qcov=0.347; evalue=5.08e-29; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026117

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057811868.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057811868.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811868.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811868.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811868.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:53249534`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B137
`Chr5:53249534`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr5:53249565`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,C18,C34
`Chr5:53249599`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr5:53249613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr5:53249614`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,C27
`Chr5:53249615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	17	B123,B135,B16,B21,B36,B49,B56,B58,B67,C18,C38,C43,C46,C80,C81,C87,D1
`Chr5:53249629`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,B35
`Chr5:53249633`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	24	A14,A16,A3,B106,B121,B133,B35,B59,B6,B65,B71,B85,C14,C17,C25,C27,C38,C50,C59,C65,C73,C81,C86,D6
`Chr5:53249682`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A25
`Chr5:53249694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B59,B72,B90,B92,C21
`Chr5:53249700`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955885.1
ATGCGTGCTGGGCAGAGAACTACTTATCTGGGCATCCCTAGTACTGTGGGCCAATCGAAGAGTGAGATCTTCCAGATGCTGGTGGATCGGACGCGAAAAAAGTCTAAGGATTGGAAAAGAAGGTTTTTGTTGGGAGCGGGTAAAATGGTGCTCATTAAAGCAGTCCTCCAGTCTATTCCTTCATACATTATGAGTTGTTTTGCGTTGCCGGATCAAGTTTGTCAACAACTTAACAGCGTGGCGGTGCGGTTTTTTTGGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026117
ATGCGTGCTGGGCAGAGAACTACTTATCTGGGCATCCCTAGTACTGTGGGCCAATCGAAGAGTGAGATCTTCCAGATGCTGGTGGATCGGACGCGAAAAAAGTCTAAGGATTGGAAAAGAAGGTTTTTGTTGGGAGCGGGTAAAATGGTGCTCATTAAAGCAGTCCTCCAGTCTATTCCTTCATACATTATGAGTTGTTTTGCGTTGCCGGATCAAGTTTGTCAACAACTTAACAGCGTGGCGGTGCGGTTTTTTTGGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811868.1
MRAGQRTTYLGIPSTVGQSKSEIFQMLVDRTRKKSKDWKRRFLLGAGKMVLIKAVLQSIPSYIMSCFALPDQVCQQLNSVAVRFFWGQKNDERRIHWKSWKKICVPKGEGCLGFRDIALFNQAMLAKQVWRLLTNDTSLLARSLKARYFPINDLLLASNAHNPSYAWKSLLVGRDLIVKGLALEVRKWGANRIGVDSWLLDGKGQFFTAKVDDGFANLTAQEMMNGDLDAWDCEKIEEILQPSDRQKVLFQIQPKPNEKD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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