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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003956`

染色体: Chr05 坐标: 53293288-53297135 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003956`
名称	SmilChr05G003956
描述	DET1- and DDB1-associated protein 1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	53293288 - 53297135 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024990`
GeneID	`131024990`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024990`
原始查询	`SmilChr05G003956`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DET1- and DDB1-associated protein 1
产物	DET1- and DDB1-associated protein 1
Arabidopsis	`AT5G41560` (AT5G41560) DET1 complexing ubiquitin ligase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834158] identity=59.4; qcov=0.941; evalue=8.07e-33; confidence=medium
Rice	`Os03g0125700` - identity=52; qcov=0.961; evalue=1.75e-24; confidence=medium
GO	GO:0032436 (positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process); GO:0080008 (Cul4-RING E3 ubiquitin ligase complex)
KEGG	-
Pfam	PF10172 (DDA1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024990

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810572.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057810571.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057810572.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810571.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810571.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:53293613`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B138,B7,C11,C69
`Chr5:53293791`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B49,B50,C10,C63
`Chr5:53293822`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr5:53294008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:53296209`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	14	B105,B135,B15,B31,B38,B39,B78,B9,C12,C47,C80,C84,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810571.1

147 aa

147

DDA1

PF10172 DDA1 7-71 aa

XP_057810572.1

104 aa

104

DDA1

PF10172 DDA1 7-71 aa

XP_057810573.1

102 aa

102

DDA1

PF10172 DDA1 7-71 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810571.1`	Pfam	`PF10172`	DDA1	Family	7	71	1.5e-25	89.8	Det1 complexing ubiquitin ligase
`XP_057810572.1`	Pfam	`PF10172`	DDA1	Family	7	71	8.3e-26	90.7	Det1 complexing ubiquitin ligase
`XP_057810573.1`	Pfam	`PF10172`	DDA1	Family	7	71	7.9e-26	90.7	Det1 complexing ubiquitin ligase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954588.1
TAGTATTTATCAATGCACTTTTTTTTTCTTTTCTCTTGGCACTATATTTGCACGAAGAGCAAAAGTGCTGGCATATTGATGAATATTTAATTCAAACTAGCATTTACACTCATGCAATACATGAGTAATATTTTTATATTTTTTATAAGTAAAATAAATAAATTGTAGTAAGTTAAAATAACAAAAATAAATTGACAATAAATAAGAATTAAAAATTAACTTATTTAAAAAAGAGAAGAGAGTAGTATATGTTTTTAAGT...

XM_057954590.1
TTTTGTTTTTATAAATTTTAAGTTTTAATTTTTAAACAAACATAACTTTTACATTTTAAATTTGATATTTACATAAAATATATCAAATTTGATATATATTTTAATTTGATATTGTATTTTTAATTTGATATGCATATAAATATTTTATAATTAGCCCAACTTCATAGTTTTAGAAAATAAATAAAATAGAAAAATTAGAAGATAAAGAAAAAAATAATTTATATTAAAATTTAAAATTAGTGCTATTTTTTTAAATATAT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131024990
ATGTTTTTTGCTGATGATTCAATGCTTGGAAGCTGGCCCTCCCTCGACCCTCACAACTTCAGCCAGTTAAAGCCCAATGATCCTTCCAATCCATCGAAAATGACGCTTGTTACGTATAATCCTACTCATGACCGCACCCTCCCTCCGCCTGATCAGGTTATAACGCCGGAAGCGAGAAACATTCTCCTGAGGCACTTCTATCAACACGCTGAAGATAAGCTGCTCAGTACCAAGAGAGGTTCGTCCGAGAATCCGGCGCC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057810571.1
MFFADDSMLGSWPSLDPHNFSQLKPNDPSNPSKMTLVTYNPTHDRTLPPPDQVITPEARNILLRHFYQHAEDKVSILITMLLSYLLLYWLIAYRLFNFHLIMLLHTFIRYNVVFANRLPRVNYSASHVNSKFDRNSRWYQNQIKLIV

XP_057810572.1
MFFADDSMLGSWPSLDPHNFSQLKPNDPSNPSKMTLVTYNPTHDRTLPPPDQVITPEARNILLRHFYQHAEDKLQLLSTKRGSSENPAPERASKLPRASASDNG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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