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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003957`

染色体: Chr05 坐标: 53301504-53313123 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003957`
名称	SmilChr05G003957
描述	E4 SUMO-protein ligase PIAL2
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	53301504 - 53313123 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024903`
GeneID	`131024903`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024903`
原始查询	`SmilChr05G003957`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	E4 SUMO-protein ligase PIAL2
产物	E4 SUMO-protein ligase PIAL2
Arabidopsis	`AT5G41580` (AT5G41580) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834160] identity=43.6; qcov=0.606; evalue=4.69e-128; confidence=medium
Rice	`Os06g0164000` - identity=31.6; qcov=1.06; evalue=1.59e-118; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0016925 (protein sumoylation); GO:0061665 (SUMO ligase activity)
KEGG	smil04120 (Ubiquitin mediated proteolysis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02891 (zf-MIZ); PF26716 (PIAL1_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024903

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810434.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057810434.1`
3	PML body	PML body	0.20000	`XP_057810435.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810434.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810434.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:53301833`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,A5,B71,C55
`Chr5:53302711`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	A21,A8,B79,C13,C70
`Chr5:53302711`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	5	A21,A8,B79,C13,C70
`Chr5:53302816`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr5:53303221`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr5:53312939`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B72,C83,D10
`Chr5:53313033`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C3
`Chr5:53313033`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C3
`Chr5:53313036`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810434.1

841 aa

420

841

PIAL1_N

zf-MIZ

PF26716 PIAL1_N 74-204 aa PF02891 zf-MIZ 337-385 aa

XP_057810435.1

814 aa

407

814

PIAL1_N

zf-MIZ

PF26716 PIAL1_N 24-177 aa PF02891 zf-MIZ 310-358 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810434.1`	Pfam	`PF26716`	PIAL1_N	Domain	74	204	3.3e-62	209.6	E4 SUMO-protein ligase PIAL1, N-terminal domain
`XP_057810434.1`	Pfam	`PF02891`	zf-MIZ	Domain	337	385	1.9e-20	73.1	MIZ/SP-RING zinc finger
`XP_057810435.1`	Pfam	`PF26716`	PIAL1_N	Domain	24	177	4.9e-64	215.5	E4 SUMO-protein ligase PIAL1, N-terminal domain
`XP_057810435.1`	Pfam	`PF02891`	zf-MIZ	Domain	310	358	1.9e-20	73.1	MIZ/SP-RING zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954452.1
GTTTAGGATTTATGATGATTTTAAAAACAAAGGGAAAGAGGGAAAGAGGCGCAGGGTAGTAAACTGGATGAATGGCCGGAACAACAGCGGCGTCGGCGACTGGGTTGAGCTCCGGCGTCCAGAACACCAGCTTGAACCCGACGCAGTTAAATAACTTCCGAATTTCCGCCGTCATCGATCGTTTGTTGATTCACTTATACAACAACAGTAAAAACCACACCGAGTTCGAAAATCTCTGCCTCTCGCTTGCCAGAGGTATT...

XM_057954451.1
GTTTAGGATTTATGATGATTTTAAAAACAAAGGGAAAGAGGGAAAGAGGCGCAGGGTAGTAAACTGGATGAATGGCCGGAACAACAGCGGCGTCGGCGACTGGGTTGAGCTCCGGCGTCCAGAACACCAGCTTGAACCCGACGCAGTTAAATAACTTCCGAATTTCCGCCGTCATCGATCGTTTGTTGATTCACTTATACAACAACAGTAAAAACCACACCGAGTTCGAAAATCTCTGCCTCTCGCTTGCCAGTTTCATT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131024903
ATGGCCGGAACAACAGCGGCGTCGGCGACTGGGTTGAGCTCCGGCGTCCAGAACACCAGCTTGAACCCGACGCAGTTAAATAACTTCCGAATTTCCGCCGTCATCGATCGTTTGTTGATTCACTTATACAACAACAGTAAAAACCACACCGAGTTCGAAAATCTCTGCCTCTCGCTTGCCAGAGGTATTGATCATGCCATTTCAAATTTTGAGACTCCAAACAGATCGCATGAGTTACCTTCTCTAATAAAGCAGGTGTG...

LOC131024903
ATGGCCGGAACAACAGCGGCGTCGGCGACTGGGTTGAGCTCCGGCGTCCAGAACACCAGCTTGAACCCGACGCAGTTAAATAACTTCCGAATTTCCGCCGTCATCGATCGTTTGTTGATTCACTTATACAACAACAGTAAAAACCACACCGAGTTCGAAAATCTCTGCCTCTCGCTTGCCAGTTTCATTTCAGGTGATTTATTTCCAAAAAGTCACGGAGGTGATTCTACTGCACTTCAAGATATTTGCATTGCAATTTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057810434.1
MAGTTAASATGLSSGVQNTSLNPTQLNNFRISAVIDRLLIHLYNNSKNHTEFENLCLSLASFISGDLFPKSHGGDSTALQDICIAISRGIDHAISNFETPNRSHELPSLIKQVCQMKNDNTAMQAALMVLMISIKSACQNGWFSDQDSEELSNLAKKVASNFCSASNFTAEPNPSHPVISAVMSRYYPRLRMGHIFVFLEVKPGFDAYVSDFQITKKKCSPGDKIRLLVVQTDNIETSSCLVTPAKVNFLLDGKGVERRT...

XP_057810435.1
MAGTTAASATGLSSGVQNTSLNPTQLNNFRISAVIDRLLIHLYNNSKNHTEFENLCLSLARGIDHAISNFETPNRSHELPSLIKQVCQMKNDNTAMQAALMVLMISIKSACQNGWFSDQDSEELSNLAKKVASNFCSASNFTAEPNPSHPVISAVMSRYYPRLRMGHIFVFLEVKPGFDAYVSDFQITKKKCSPGDKIRLLVVQTDNIETSSCLVTPAKVNFLLDGKGVERRTNLNMDTGPQVPTVVTSLLKYGSNLLQA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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