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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003958`

染色体: Chr05 坐标: 53317227-53323635 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003958`
名称	SmilChr05G003958
描述	uncharacterized SmilChr05G003958
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	53317227 - 53323635 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024914`
GeneID	`131024914`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024914`
原始查询	`SmilChr05G003958`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842709]; symbol=AT1G64050; hit=AT1G64050; species=arabidopsis; confidence=low
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842709]; symbol=AT1G64050; hit=AT1G64050; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G64050` (AT1G64050) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842709] identity=32.5; qcov=0.736; evalue=3.89e-53; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024914

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810457.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810457.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810457.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810457.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057810457.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:53319698`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B135,B99,C46,C66,C87
`Chr5:53319702`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B13,B135,B48,C70,C8,D2
`Chr5:53319711`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B13,B135,B48,C70,C8,D2
`Chr5:53319760`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr5:53319809`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B13,B135,B48,C70,C8,D2
`Chr5:53321168`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B72,C83,D10
`Chr5:53321185`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr5:53321204`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,C22
`Chr5:53321275`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	37	A10,A15,A19,B105,B108,B122,B136,B137,B138,B21,B24,B26,B37,B45,B46,B49,B52,B57,B67,B7,B73,B78,B79,B80,B84,B87,C31,C48,C57,C66,C70,C8,C81,C9,D1,D10,D5
`Chr5:53321414`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B137,B52,B80,C70
`Chr5:53321414`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B137,B52,B80,C70
`Chr5:53322798`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954474.1
GTAAAGAAAAAGAAGCTTTGACAGCACGTGGACTTAAAATAAGAAATCTGAAACGGGATTACGGTGACTCCTACCGCACTGGAATATGCCCCGTGCTTTTTCCTGCTTTTCCCGAAAACTATAAATACCTTCTTCTCCGTCAATCCCCTCAATTTCGTGCCCTAGACTTCCAATTTCAGCCGCAACATGCCACCTCCGCGCCAATTATCCGTTCCCCCCTCTAAATCCCTTCGCCGCTCTCTCAACGCTCGATCTCCGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024914
ATGGGCTCACAGGAGGTTTTCGGCAGCGGCAGTGGCGGCGTGGTGGTGGGGGAAGTTCGGTGGCGTAGTGAAGGTGGGTGCAGCTCAGTTGGTAGAAAAGATGACATAATTGCTGCTAATGTCTCAGTCCCGTCTTTTTGGCATAAGGTTCCCAATCCTGAATGTGGTTTGGGGATCTCTCAACCCTCCAGTTTGCACAGTGATGAAATGTATAGTGGTCATGATTTGGGGAACTCGAGTTCTGATCCTCCAACACTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810457.1
MGSQEVFGSGSGGVVVGEVRWRSEGGCSSVGRKDDIIAANVSVPSFWHKVPNPECGLGISQPSSLHSDEMYSGHDLGNSSSDPPTLEVDVKCLTQKSGKIERKNGGYTKRSGMAQMEISKSKLGYDANGVSPELVALSSASCNTSEKNQIIKQNNSVSSRRGDKRTSRFKQKSRCDPFSLKNSLVGFNSAAGGNSFLGMYGLKPDVFDITKLVNELPLHDLLSGNYTSPSISKDKGKKSASSNNDLMQSVRKACSVLQAK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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