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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003969`

染色体: Chr05 坐标: 53445480-53446070 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003969`
名称	SmilChr05G003969
描述	uncharacterized SmilChr05G003969
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	53445480 - 53446070 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026119`
GeneID	`131026119`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026119`
原始查询	`SmilChr05G003969`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os06g0523701` - identity=33.9; qcov=0.872; evalue=1.67e-25; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	PF24964 (DUF7769)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026119

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811871.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057811871.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811871.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811871.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811871.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:53445487`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B40,C2,C26
`Chr5:53445492`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B66,C48,C82
`Chr5:53445520`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	B100,B59,B9,B98,C58,C85,D1
`Chr5:53445524`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	B100,B59,B9,B98,C58,C85,D1
`Chr5:53445527`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr5:53445576`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	22	A16,A25,A4,B120,B125,B135,B16,B38,B39,B52,B70,B79,C16,C27,C29,C39,C46,C47,C5,C72,C79,D5
`Chr5:53445583`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,C82,D7
`Chr5:53445590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr5:53445596`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B99,C64,C66
`Chr5:53445606`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,C2,C26
`Chr5:53445607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,C2,C26
`Chr5:53445619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,C47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811871.1

196 aa

196

DUF7769

PF24964 DUF7769 6-60 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811871.1`	Pfam	`PF24964`	DUF7769	Domain	6	60	6.8e-08	32.8	Domain of unknown function (DUF7769)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955888.1
ATGGGGCGAAAAGATCTAACAACAGGCGAGAGAAACTCGATAAAGCAGTTTGTGCTTGAAGACAGCCATGGTGGGAAGCCAAAACGGGGCAGAATTCAGGCTGCTGCCGTCAAGTTCGGCGTTTGCCGTCAGAAGGTGACGCGACTATGGACTGCTGCAAAAAAACAACAAAATCAAGGTCAGCATATGCATTCAATCAGTGGCAAAATCAACAAACGAAGACGCAAGAGAGTTGAAATAGATCTTCAATTAATTTCAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026119
ATGGGGCGAAAAGATCTAACAACAGGCGAGAGAAACTCGATAAAGCAGTTTGTGCTTGAAGACAGCCATGGTGGGAAGCCAAAACGGGGCAGAATTCAGGCTGCTGCCGTCAAGTTCGGCGTTTGCCGTCAGAAGGTGACGCGACTATGGACTGCTGCAAAAAAACAACAAAATCAAGGTCAGCATATGCATTCAATCAGTGGCAAAATCAACAAACGAAGACGCAAGAGAGTTGAAATAGATCTTCAATTAATTTCAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811871.1
MGRKDLTTGERNSIKQFVLEDSHGGKPKRGRIQAAAVKFGVCRQKVTRLWTAAKKQQNQGQHMHSISGKINKRRRKRVEIDLQLISTLELSKRSTIRRLASGINCSKSTVRRWISKGLIRAHTNAIKPDLTAPHKLLRLKFSLEAIEYDRILKVLQFKSMHNTVHIDEKLFYITKANHRFYLTPGEGEYMQYVAQQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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