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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003970`

染色体: Chr05 坐标: 53462133-53465688 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003970`
名称	SmilChr05G003970
描述	heat stress transcription factor C-1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	53462133 - 53465688 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025038`
GeneID	`131025038`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025038`
原始查询	`SmilChr05G003970`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	heat stress transcription factor C-1
产物	heat stress transcription factor C-1
Arabidopsis	`AT3G24520` (HSFC1) heat shock transcription factor C1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822047] identity=56.5; qcov=0.447; evalue=8.55e-44; confidence=low
Rice	`Os07g0178600` (HSFA2B) - identity=43.3; qcov=0.531; evalue=7.82e-30; confidence=medium
GO	GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II)
KEGG	-
Pfam	PF00447 (HSF_DNA-bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025038

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810610.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810610.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810610.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810610.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057810610.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:53462444`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:53462493`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr5:53462550`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D11
`Chr5:53462550`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D11
`Chr5:53462553`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D11
`Chr5:53462553`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D11
`Chr5:53462590`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:53462653`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr5:53462758`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B140,B68,C8
`Chr5:53463049`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B134,B4,B88
`Chr5:53463130`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C22
`Chr5:53463130`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810610.1

353 aa

176

353

HSF_DNA-bind

PF00447 HSF_DNA-bind 19-108 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810610.1`	Pfam	`PF00447`	HSF_DNA-bind	Domain	19	108	6e-29	101.2	HSF-type DNA-binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954627.1
CCCATCCCGTGACCCCTCTCAAAAATATCTGACCCGATCTCCATAAAGCTCCACGATTCCACATTTTCATTTTCTTTTTAGCTTCACTGTGCATGGCCCTACCCAGACCCGGACCCGGACTCGGACCCGGATCACAAGCCCGTAGGACCCAGCCCGCCCACACCTTATATCATGGTGTCCTCTCACCATCACAATTGAATGCAGAGTTACTTGTTCCTTATGGTGTAGCTAGCTAATTGCTTTCTCTCTCTATTCTCTCT...

XM_057954628.1
ACCCGATCTCCATAAAGCTCCACGATTCCACATTTTCATTTTCTTTTTAGCTTCACTGTGCATGGCCCTACCCAGACCCGGACCCGGACTCGGACCCGGATCACAAGCCCGTAGGACCCAGCCCGCCCACACCTTATATCATGGTGTCCTCTCACCATCACAATTGAATGCAGAGTTACTTGTTCCTTATGGTGTAGCTAGCTAATTGCTTTCTCTCTCTATTCTCTCTCTCTGTAGAAGGAAGGCTGGTGTGTGTGGGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131025038
ATGCGCGGGATGGAGGTTAACGATAACAGCAGCAGTAGTAATACAGTGGCGCCGTTTGTGATGAAAACCTACCAAATGGTGAACGATCCGGCGACGAATCGGCTCATCGCGTGGGGGAGGGCAAACAATAGTTTCATCGTTTTGGAGCCGTTGGATTTCTCGCAGAGGATTTTGCCGGCATACTTTAAGCATCATAATTTCTCCAGCTTCGTGCGCCAGCTCAATACTTATGGTTTCAGAAAGGTGGATCCGGATAGGTG...

LOC131025038
ATGTATTGGAGAGCTCATCCAATTTTGGGGGAGGAGCGGCGGAGAGGATTCATAAAGTGTGAAATTCGATTGTGGCTGTGGAGGCGGTCGGCAATGGCGGGTTTCAGAAAGGTGGATCCGGATAGGTGGGAGTTCGCCAACGAGTGGTTCCTACGCGGCCAAACGCATCTACTCTGCAACATCGCGAGGCGGAAACACACGAGCAGAAGCGGCGGCGGCCACCTCAAGCAGGAAGACGAGGAAGACGAGGTCCTAATCGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057810610.1
MRGMEVNDNSSSSNTVAPFVMKTYQMVNDPATNRLIAWGRANNSFIVLEPLDFSQRILPAYFKHHNFSSFVRQLNTYGFRKVDPDRWEFANEWFLRGQTHLLCNIARRKHTSRSGGGHLKQEDEEDEVLIAEIAKLKQEQKSLEQELQSMNRRLEATERRPQQMMTFLCKVVQDPDILPQIMLEKEKMRRLTPDKKRKLMITTSSSNSLSGTAHSGSSVKSEDDQDQDQDQDHDRPNAMAESTPISSPDGNFDHDAYPSS...

XP_057810611.1
MYWRAHPILGEERRRGFIKCEIRLWLWRRSAMAGFRKVDPDRWEFANEWFLRGQTHLLCNIARRKHTSRSGGGHLKQEDEEDEVLIAEIAKLKQEQKSLEQELQSMNRRLEATERRPQQMMTFLCKVVQDPDILPQIMLEKEKMRRLTPDKKRKLMITTSSSNSLSGTAHSGSSVKSEDDQDQDQDQDHDRPNAMAESTPISSPDGNFDHDAYPSSPSLEMSSPEWLSHGRFNVGVSMPIIRPDHRPNYANLSSPSGIDL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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