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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003981`

染色体: Chr05 坐标: 53611395-53619190 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003981`
名称	SmilChr05G003981
描述	uncharacterized SmilChr05G003981
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	53611395 - 53619190 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026121`
GeneID	`131026121`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026121`
原始查询	`SmilChr05G003981`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G29090` (AT4G29090) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030] identity=31.1; qcov=0.436; evalue=1.25e-07; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=32.2; qcov=0.486; evalue=6.19e-10; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026121

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811872.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057811872.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811872.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811872.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811872.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:53611412`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B39,B78
`Chr5:53611419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr5:53611521`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,C45
`Chr5:53611524`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr5:53611533`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	42	A13,A21,A23,B118,B119,B120,B125,B128,B136,B15,B23,B26,B34,B4,B50,B52,B63,B70,B75,B76,B86,B87,B91,C1,C2,C22,C27,C30,C36,C38,C39,C5,C50,C53,C57,C60,C63,C65,C70,C80,C81,C82
`Chr5:53611562`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr5:53618720`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr5:53618734`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	17	A2,A5,B137,B2,B47,B48,B5,B92,B95,C11,C14,C2,C27,C31,C41,C55,C8
`Chr5:53618743`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C35
`Chr5:53618804`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C73
`Chr5:53618804`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr5:53618879`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	39	A19,A25,A3,A5,B105,B107,B127,B128,B137,B28,B42,B43,B49,B61,B65,B71,B74,B79,B8,B87,B88,B90,B91,B92,B94,C1,C18,C20,C43,C44,C49,C51,C57,C62,C65,C71,C80,D2,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811872.1

243 aa

122

243

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 32-121 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811872.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	32	121	5.1e-15	56.6	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955889.1
ATGGTGGAGGAACTTATGTTGGCTGTTTCAGATTTTGCTCCTTGCACAGGTTCAAGCGATGAGTGGAGATGGACGGCGACAACGGATGGCTTATTCACAACCAAGTCGGCATACGATCTCCTTGCGGTGATCAAAGGAGAGCAACAAATCCAGCCTTTGGAGCTGGCCAAAGTTTGGGAAGCTCCGACGCCGCATAAAGCCAAAGTGACTGCTTGGAGATGCCTGAGAAATAGATTGGCAACGTGTGATAATTTGCTTAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026121
ATGGTGGAGGAACTTATGTTGGCTGTTTCAGATTTTGCTCCTTGCACAGGTTCAAGCGATGAGTGGAGATGGACGGCGACAACGGATGGCTTATTCACAACCAAGTCGGCATACGATCTCCTTGCGGTGATCAAAGGAGAGCAACAAATCCAGCCTTTGGAGCTGGCCAAAGTTTGGGAAGCTCCGACGCCGCATAAAGCCAAAGTGACTGCTTGGAGATGCCTGAGAAATAGATTGGCAACGTGTGATAATTTGCTTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811872.1
MVEELMLAVSDFAPCTGSSDEWRWTATTDGLFTTKSAYDLLAVIKGEQQIQPLELAKVWEAPTPHKAKVTAWRCLRNRLATCDNLLRRNIQLGIEERWCNACVSCEETAEHLFLHCPKAEAVGDQIQQWLNIKTAKPRGILQHFISFISERKGKKGRRLLLALWVGTIGMLWKSINESRFQSKISKSFEMFKNTLWSWSLNAQPSLHSIPDIFDFWAANEGFLLIAASIAQIFHFSNRDVSSP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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