当前解析结果
SmilChr05G003992| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003992 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003992 |
| 描述 | ethylene-responsive transcription factor CRF3-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 53760716 - 53761432 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131026122 |
|---|---|
| GeneID | 131026122 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131026122 |
| 原始查询 | SmilChr05G003992 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | ethylene-responsive transcription factor CRF3-like |
| 产物 | ethylene-responsive transcription factor CRF3-like |
| Arabidopsis | AT1G68550 (CRF10)Integrase-type DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843184] identity=40.3; qcov=0.521; evalue=9.73e-14; confidence=low |
| Rice | Os09g0309700 (ERF109)- identity=35; qcov=0.601; evalue=9.56e-13; confidence=low |
| GO | GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131026122 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057811873.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057811873.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057811873.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057811873.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057811873.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:53760770 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C87 |
Chr5:53760819 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C87 |
Chr5:53761266 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr5:53761430 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 16 | A1,A8,B101,B115,B18,B24,B29,B35,B64,B97,C28,C67,C82,C83,D7,D8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。