当前解析结果
SmilChr05G004001| 统一新 Gene ID | SmilChr05G004001 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G004001 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G004001 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 53916426 - 53918786 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131025069 |
|---|---|
| GeneID | 131025069 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025069 |
| 原始查询 | SmilChr05G004001 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | translocase subunit seca [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843178]; symbol=AT1G68490; hit=AT1G68490; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | translocase subunit seca [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843178]; symbol=AT1G68490; hit=AT1G68490; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT1G68490 (AT1G68490)translocase subunit seca [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843178] identity=52.6; qcov=1.03; evalue=5.62e-52; confidence=high |
| Rice | Os12g0600701- identity=31.8; qcov=0.914; evalue=1.19e-09; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025069 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057810652.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057810652.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057810652.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057810652.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057810652.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:53916968 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B76 |
Chr5:53917019 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B13 |
Chr5:53917035 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B13,B21 |
Chr5:53917584 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B24,B35,C21,C3 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。