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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004003`

染色体: Chr05 坐标: 53941056-53943813 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004003`
名称	SmilChr05G004003
描述	50S ribosomal protein L15, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	53941056 - 53943813 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025071`
GeneID	`131025071`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025071`
原始查询	`SmilChr05G004003`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	50S ribosomal protein L15, chloroplastic
产物	50S ribosomal protein L15%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G25920` (RPL15) ribosomal protein L15 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822189] identity=67.6; qcov=0.963; evalue=4.14e-116; confidence=high
Rice	`Os03g0219900` - identity=61.2; qcov=0.996; evalue=7.67e-99; confidence=high
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00828 (Ribosomal_L27A); PF29471 (Ribosomal_uL15_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025071

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057810655.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810655.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810655.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810655.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810655.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:53941197`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B3,C35
`Chr5:53941203`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B72,B90,B92,C21,C74
`Chr5:53941249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B121,B32,B54,C36
`Chr5:53941305`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr5:53941321`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr5:53941323`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr5:53941374`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B72,B90,B92,C21,C74
`Chr5:53941787`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr5:53941832`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,B80
`Chr5:53943428`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr5:53943483`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810655.1

269 aa

134

269

Ribosomal_uL15_N

Ribosomal_L27A

PF29471 Ribosomal_uL15_N 99-135 aa PF00828 Ribosomal_L27A 157-229 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810655.1`	Pfam	`PF29471`	Ribosomal_uL15_N	Family	99	135	4.3e-14	52.9	Ribosomal protein uL15, N-terminal region
`XP_057810655.1`	Pfam	`PF00828`	Ribosomal_L27A	Domain	157	229	3.9e-16	60.0	Ribosomal proteins 50S-L15, 50S-L18e, 60S-L27A

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954672.1
CGCACATAAAATAAAATAAAGAGAAGAGAGCGAAAATGGCAACAAAATTGGAAAAAGACTAAAACTTTATCATATTATCTTCTCGTTGCGATGGCTACTTGCTTACTCTCCCTCTCCTCCCCCACCACTTCCACAGCTACTCCTCATCTGCGCCTCTTCTCTTCTCATTTCAAGGGAAGTGTGAGAAATCTGAGGGCGAGCCCATCTCCGTTTCCTTCAATAAACCTCTGCCACCACAAAGCGAAGCCACGGAAGCCGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025071
ATGGCTACTTGCTTACTCTCCCTCTCCTCCCCCACCACTTCCACAGCTACTCCTCATCTGCGCCTCTTCTCTTCTCATTTCAAGGGAAGTGTGAGAAATCTGAGGGCGAGCCCATCTCCGTTTCCTTCAATAAACCTCTGCCACCACAAAGCGAAGCCACGGAAGCCGCTTCTTGTTCAGAATTCCGCGGCCGTCCAGGAAACTTCTGGAAGCGTCGAGAATGGTCGATTCCGCCTCAATAACTTGGGCCCGCAGCCGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810655.1
MATCLLSLSSPTTSTATPHLRLFSSHFKGSVRNLRASPSPFPSINLCHHKAKPRKPLLVQNSAAVQETSGSVENGRFRLNNLGPQPGSRKNAKRKGRGHAAGQGGSCGFGMRGQKSRSGPGVRRGFEGGQMPLYRRLPKLRGIAGGMRAGLPKYVPVNLKDIADAGFQEGEEVSLESLKKKGLINPSGRERRLPLKILGDGDLSVKLDFKARAFSAAAKEKIEAAGCSLTVLPGRKKWVKPSVTKNLARAEEYFAKKRAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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