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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004006`

染色体: Chr05 坐标: 53993663-53995277 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004006`
名称	SmilChr05G004006
描述	endonuclease 2-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	53993663 - 53995277 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026123`
GeneID	`131026123`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026123`
原始查询	`SmilChr05G004006`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	endonuclease 2-like
产物	endonuclease 2-like
Arabidopsis	`AT1G68290` (ENDO2) endonuclease 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843158] identity=54.4; qcov=1.05; evalue=4.55e-111; confidence=high
Rice	`Os01g0128100` - identity=57.9; qcov=0.965; evalue=1.07e-110; confidence=high
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004519 (endonuclease activity); GO:0006308 (DNA catabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF02265 (S1-P1_nuclease)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026123

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057811875.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811875.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811875.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811875.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811875.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:53993776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B98,C45,C85
`Chr5:53993885`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B85,C16,C54
`Chr5:53994156`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,D1
`Chr5:53994533`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	33	A13,A22,A8,B100,B101,B102,B106,B107,B131,B14,B16,B19,B35,B46,B47,B53,B56,B65,B68,B81,B96,C10,C17,C32,C53,C56,C61,C63,C65,C68,C76,C77,D6
`Chr5:53994538`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C23
`Chr5:53994538`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr5:53994879`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,B24
`Chr5:53995032`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr5:53995040`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B102,B24
`Chr5:53995040`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B102,B24
`Chr5:53995042`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	13	A21,B101,B106,B109,B122,B21,B69,B76,C23,C25,C40,C5,C72
`Chr5:53995193`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,C22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811875.1

283 aa

142

283

S1-P1_nuclease

PF02265 S1-P1_nuclease 27-282 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811875.1`	Pfam	`PF02265`	S1-P1_nuclease	Domain	27	282	4.2e-75	253.6	S1/P1 Nuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955892.1
ATGGAAAATGGCAAACTTTTTCATATAATATTGATCTCATTTTCACTCATAATAATTGCAACTCCATGTGCACATGGTTGGGGCTACGAAGGCCACACAGCCGTGTGCAGAATCGCACAGGCGAGATTGAGCAAAGCAGCGGCAGCAGTAGTTAAGAAACTGCTGCCGGCCTATGCAAACGGCAATTTAGGAGCGCTGTGCCCGTGGGCCGACACAGTCAAGTTCCGTTACCCGTGGTCGCGGCCGCTGCATTTCATCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026123
ATGGAAAATGGCAAACTTTTTCATATAATATTGATCTCATTTTCACTCATAATAATTGCAACTCCATGTGCACATGGTTGGGGCTACGAAGGCCACACAGCCGTGTGCAGAATCGCACAGGCGAGATTGAGCAAAGCAGCGGCAGCAGTAGTTAAGAAACTGCTGCCGGCCTATGCAAACGGCAATTTAGGAGCGCTGTGCCCGTGGGCCGACACAGTCAAGTTCCGTTACCCGTGGTCGCGGCCGCTGCATTTCATCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811875.1
MENGKLFHIILISFSLIIIATPCAHGWGYEGHTAVCRIAQARLSKAAAAVVKKLLPAYANGNLGALCPWADTVKFRYPWSRPLHFINTPDHLCSYSYARDCIDKSGEKGFCLAGAINNYTNELLDYNKKKQQYNLTESLLFASHFMGDIHQPLHVGFTSDKGGNTINVKWFKRTTELHHVWDTDIIKKAQGKGANATDMNGFSQWRNQVKGWVFCTLGCTNSYATESITAACQWAYKGVQSGSTLADTNIVADKYFNTRL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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