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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004012`

染色体: Chr05 坐标: 54057630-54059251 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004012`
名称	SmilChr05G004012
描述	uncharacterized SmilChr05G004012
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	54057630 - 54059251 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025079`
GeneID	`131025079`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025079`
原始查询	`SmilChr05G004012`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT1G25370; symbol=AT1G25370; hit=AT1G25370; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT1G25370; symbol=AT1G25370; hit=AT1G25370; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G25370` (AT1G25370) - identity=35; qcov=1.02; evalue=1.35e-38; confidence=low
Rice	`Os01g0689000` - identity=68.3; qcov=0.199; evalue=1.32e-14; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07797 (DUF1639)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025079

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810664.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810664.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810664.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810664.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057810664.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:54058035`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B5,B74
`Chr5:54058044`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr5:54058374`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr5:54058436`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B52
`Chr5:54058457`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B61,C43,C49,C71
`Chr5:54058636`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr5:54058835`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810664.1

301 aa

150

301

DUF1639

PF07797 DUF1639 245-294 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810664.1`	Pfam	`PF07797`	DUF1639	Family	245	294	3.7e-28	98.0	Protein of unknown function (DUF1639)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954681.1
TCCCGGCGATTTTCCCATAATTTTCCTCACACCGCAAAATAGGAGATTGAGAGAGAAAAAAAGAAAAAAGGAAAAAAGTATATAAGTATATAAGCAAACAACTTCAATCACCTCTCAAATTCGGAGAAATTGAAGCTCGGGGATTCCTCAGAGTGTGTGTATGTGTGCGGAATCGTGAAAATCTTCATGGCTATGGGGACGGAACGATCGAAGGCGTTGCACAATTTCACGATGCCGTGCGGCCTGCGGTGGGGCAATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025079
ATGGCTATGGGGACGGAACGATCGAAGGCGTTGCACAATTTCACGATGCCGTGCGGCCTGCGGTGGGGCAATCACAGGATCCTCCGCTGCATGAGGGTCAACTCCGACGGCCAGACCTCCCCGCTCCGCCGCCACGCCGCCGGCTCCTCCGGCGGCGCCGATCACCACCACCGCAGCCACCACCCAATCCAGCAGCGCCGCACCACCAGGGAGCGGGACAAGGACGACTTCGCGCATCACGAATCCCCCAAACTGGGCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810664.1
MAMGTERSKALHNFTMPCGLRWGNHRILRCMRVNSDGQTSPLRRHAAGSSGGADHHHRSHHPIQQRRTTRERDKDDFAHHESPKLGPTPFPYGGRRFSDDADDGIAATREKVMLDLQTAADKMKDAIFKDGLEEGEVSASLPQPPPPPPPPPAASADAEGEAYCPWNLRTRRAAGRSGGSPAVGGGGDGVGGKSLRMDAPPRPAGSSQMRAAGQKSPMHRSDGGGGTSAAASGEKREREKFAVALSKRDIEEDFYAMVGH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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