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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004015`

染色体: Chr05 坐标: 54111903-54112851 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004015`
名称	SmilChr05G004015
描述	zinc finger protein GIS3-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	54111903 - 54112851 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025080`
GeneID	`131025080`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025080`
原始查询	`SmilChr05G004015`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger protein GIS3-like
产物	zinc finger protein GIS3-like
Arabidopsis	`AT1G68360` (AT1G68360) C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843165] identity=45.1; qcov=1.27; evalue=4.23e-52; confidence=high
Rice	`Os01g0132766` - identity=49.7; qcov=0.847; evalue=3.52e-27; confidence=medium
GO	GO:0000976 (transcription cis-regulatory region binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0009736 (cytokinin-activated signaling pathway); GO:0009740 (gibberellic acid mediated signaling pathway); GO:0010026 (trichome differentiation); GO:0010090 (trichome morphogenesis)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025080

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810665.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810665.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810665.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810665.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057810665.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:54112191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B117,B46,D1
`Chr5:54112224`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr5:54112278`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr5:54112290`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,C85
`Chr5:54112298`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B4,B99,C59
`Chr5:54112299`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr5:54112311`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D9
`Chr5:54112311`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D9
`Chr5:54112314`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr5:54112320`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr5:54112365`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B42
`Chr5:54112466`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954682.1
GATATGCAACAACTCCCTTGAACCTCACTCTCTCCTTTCTGTCTCACTTTCTCTCACTAAAAATAGTAAAAATCACACGTCAACATATCTACACACACATATACACCATTAGTGTGTGTAGTATAGTATGGCGGAGATAGAGTATGAAAGCAAAGCATGCAGCAACGGCCCATTAAAATTAAAACTCTTCGGCTTCAACATGATGGAGGATCAAGAGGAGGCCGCCAAGTCGCCGGAATCCGCCGAGTTCCCCGCCTCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025080
ATGGCGGAGATAGAGTATGAAAGCAAAGCATGCAGCAACGGCCCATTAAAATTAAAACTCTTCGGCTTCAACATGATGGAGGATCAAGAGGAGGCCGCCAAGTCGCCGGAATCCGCCGAGTTCCCCGCCTCCGACGGCCGGAAATACGAGTGCCAGTACTGCTGCCGCGAGTTCGCCAACTCGCAGGCCCTCGGCGGCCACCAGAACGCGCACAAGAAGGAGCGGCAGCAGCTCAAGCGCGCCCAGCTGCAGGCCAGCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810665.1
MAEIEYESKACSNGPLKLKLFGFNMMEDQEEAAKSPESAEFPASDGRKYECQYCCREFANSQALGGHQNAHKKERQQLKRAQLQASRNAAASYMRNPMVSAFAPPPHLLAPLVAAPSWVYVPRGGAGAAAQPFQVSHGCVFPAGAPASRGAAEPPTPQPALRAHGGRLDGPSLSGFSMVEDGPGFYDGFGVDLQLSLAPAGS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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