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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004022`

染色体: Chr05 坐标: 54209427-54213075 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004022`
名称	SmilChr05G004022
描述	uncharacterized SmilChr05G004022
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	54209427 - 54213075 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025087`
GeneID	`131025087`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025087`
原始查询	`SmilChr05G004022`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aerobic coproporphyrinogen-III oxidase (DUF1218) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843151]; symbol=AT1G68220; hit=AT1G68220; species=arabidopsis; confidence=high
产物	aerobic coproporphyrinogen-III oxidase (DUF1218) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843151]; symbol=AT1G68220; hit=AT1G68220; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G68220` (AT1G68220) aerobic coproporphyrinogen-III oxidase (DUF1218) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843151] identity=60.5; qcov=1.01; evalue=6.06e-88; confidence=high
Rice	`Os08g0261100` - identity=56.7; qcov=0.847; evalue=3.11e-60; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06749 (DUF1218)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025087

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057810675.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810675.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810675.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810675.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810675.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:54209721`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C61,C80
`Chr5:54209730`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr5:54209745`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B87,C31,C33,C71
`Chr5:54209900`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C6,D3
`Chr5:54209921`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr5:54209980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B11,B129,C33,C78
`Chr5:54210008`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr5:54210039`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B132,B87,C27,C31,C82
`Chr5:54212675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:54212736`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr5:54212825`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	197	A10,A13,A15,A16,A19,A2,A23,A24,A3,A4,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B106,B107,B108,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B12,B121,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B137,B138,B139,B14,B16,B17,B18,B19,B20,B21,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B33,B34,B35,B36,B39,B42,B43,B45,B46,B47,B48,B49,B50,B52,B53,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B65,B66,B67,B69,B7,B70,B72,B73,B75,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B87,B88,B89,B9,B90,B92,B93,B95,B96,B97,B98,B99,C10,C11,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C27,C28,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C36,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C48,C49,C5,C51,C53,C54,C55,C56,C57,C59,C6,C61,C63,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C75,C77,C78,C79,C81,C82,C83,C86,C87,C9,D1,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr5:54212828`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	196	A10,A13,A15,A16,A19,A2,A23,A24,A3,A4,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B106,B107,B108,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B12,B121,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B137,B138,B139,B14,B16,B17,B18,B19,B20,B21,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B33,B34,B35,B36,B39,B42,B43,B45,B46,B47,B48,B49,B50,B52,B53,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B65,B66,B67,B69,B7,B70,B72,B73,B75,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B87,B88,B89,B9,B90,B92,B93,B95,B96,B97,B98,B99,C10,C11,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C27,C28,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C36,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C48,C49,C5,C51,C53,C54,C55,C56,C57,C59,C6,C61,C63,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C75,C77,C78,C79,C81,C82,C83,C86,C87,C9,D1,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810675.1

202 aa

101

202

DUF1218

PF06749 DUF1218 59-154 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810675.1`	Pfam	`PF06749`	DUF1218	Family	59	154	8.6e-28	97.4	Protein of unknown function (DUF1218)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954692.1
TTTTTATTGCAGTTGTCAATTATTTTCTATATTCTTTCTTTTCTTTTTTCCCCACAAGCGTTCGAAAAAGAAGTATAAAAGCAAAATAAAGCCAAAAATTCCTGCTTGCTTTTCTCTCTCCTCTCTCTCTCTCCACAACAAACAGTTAAAAGCTTAGTTCACACAGCTGAAAAATTCTCACTCACACATTCACACAAATTATACTGGAAATAAGCAGTAAGAAATAGCTGAAAAAATGGGAGTTTCAGTTCCCATTCTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025087
ATGGGAGTTTCAGTTCCCATTCTCGCGATCTCCATCTCTCTGCACCTCATTGCTTTCGTGCTTGCTGTCGGCGCCGAACGACGCCGTAGCACGGCGACGGTGAAGCCGGATGAGTACGACGAGAGAACGTACTGCGCGTACGGAACCGACGCGTCGACGGTGTACGGACTGGCGGCGTTCGGGCTGCTGCTGATTGCGCAGATGTTGATTCACGGCGTTACCAAGTGTTTCTGCTTTGGGAGGGGGATGATGGAAGGCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810675.1
MGVSVPILAISISLHLIAFVLAVGAERRRSTATVKPDEYDERTYCAYGTDASTVYGLAAFGLLLIAQMLIHGVTKCFCFGRGMMEGRRSTTRAVVFFVLSWIIFLAAEACLLAGSARNAYHTKYRAIFHVEHLSCATLRKGVFAAGAALTLIAMTVTTLYYWMHSKADTGGWEKHQNEGVGLTPSHFAENQHQMKTGEFQKV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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