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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004027`

染色体: Chr05 坐标: 54261108-54265250 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004027`
名称	SmilChr05G004027
描述	uncharacterized SmilChr05G004027
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	54261108 - 54265250 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026128`
GeneID	`131026128`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026128`
原始查询	`SmilChr05G004027`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Arginyl-tRNA synthetase, class Ic [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828736]; symbol=emb1027; hit=AT4G26300; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Arginyl-tRNA synthetase, class Ic [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828736]; symbol=emb1027; hit=AT4G26300; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G26300` (emb1027) Arginyl-tRNA synthetase, class Ic [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828736] identity=74.8; qcov=0.47; evalue=1.11e-67; confidence=medium
Rice	`Os01g0158500` - identity=64.9; qcov=0.526; evalue=8.26e-62; confidence=medium
GO	GO:0004814 (arginine-tRNA ligase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006420 (arginyl-tRNA aminoacylation)
KEGG	-
Pfam	PF00750 (tRNA-synt_1d)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026128

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057811880.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057811880.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057811880.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811880.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811880.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:54261142`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr5:54261163`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr5:54261357`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,B79
`Chr5:54261374`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,B8,C22,C67
`Chr5:54261379`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B70,B71,B84,C62
`Chr5:54261383`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,B79
`Chr5:54261393`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,A5,B62,C25,C75
`Chr5:54261416`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr5:54261434`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C10,C55
`Chr5:54261443`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,C69
`Chr5:54261455`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,C22,C39,C64
`Chr5:54261470`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C28

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811880.1

287 aa

144

287

tRNA-synt_1d

PF00750 tRNA-synt_1d 114-287 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811880.1`	Pfam	`PF00750`	tRNA-synt_1d	Domain	114	287	1.3e-31	110.6	tRNA synthetases class I (R), catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955897.1
ATGTCTTTGGCTCACTTGAATCTGAGGGCATACGAGAAGTTGATGCATGTAGGCCTTGAGAAGTGGGCACGATCACAATATTCGACGTCTTCTCATTTGGTTCTGGAGCAGTGGTTCAACGACAGACTTACGGTTGCACAAGAGAGCGACGAACTTCTTACTCCGGAGGCATCACAGAAGATTAGTGCGGAGATTTCAAAAAGTCGTCATTACACTGCCAAGAGGACAACCGCTAGAAAATATAGGGTTCGTGCTGGTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026128
ATGTCTTTGGCTCACTTGAATCTGAGGGCATACGAGAAGTTGATGCATGTAGGCCTTGAGAAGTGGGCACGATCACAATATTCGACGTCTTCTCATTTGGTTCTGGAGCAGTGGTTCAACGACAGACTTACGGTTGCACAAGAGAGCGACGAACTTCTTACTCCGGAGGCATCACAGAAGATTAGTGCGGAGATTTCAAAAAGTCGTCATTACACTGCCAAGAGGACAACCGCTAGAAAATATAGGGTTCGTGCTGGTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811880.1
MSLAHLNLRAYEKLMHVGLEKWARSQYSTSSHLVLEQWFNDRLTVAQESDELLTPEASQKISAEISKSRHYTAKRTTARKYRVRAGGRHFMVDLQERSCECNEFNLDSMPEANESVSDYVDTYYKRSSLIDTYSGAFDYMFGTKRLQIAVQNIKIVEEFGGYNYASTNLAALWYRLNEEKAEWIIYVTDVGQREHFEMLFAAAKRAGWLPADGSKYPKASHVGFGLVLGEDGKRFRTRSTETVKLVDLLIEAKSRCKTAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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