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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004028`

染色体: Chr05 坐标: 54291683-54296112 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004028`
名称	SmilChr05G004028
描述	uncharacterized SmilChr05G004028
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	54291683 - 54296112 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025092`
GeneID	`131025092`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025092`
原始查询	`SmilChr05G004028`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Nucleotidylyl transferase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814650]; symbol=AT2G01220; hit=AT2G01220; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Nucleotidylyl transferase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814650]; symbol=AT2G01220; hit=AT2G01220; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G01220` (AT2G01220) Nucleotidylyl transferase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814650] identity=67; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0691500` (P0034C09.16-1) - identity=64.6; qcov=0.708; evalue=1.35e-125; confidence=high
GO	GO:0000309 (nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0034356 (GO:0034356)
KEGG	-
Pfam	PF01467 (CTP_transf_like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025092

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057810682.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057810682.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057810682.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810682.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810682.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:54291954`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:54292614`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr5:54292627`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr5:54292637`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B13,B91,C12
`Chr5:54292639`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr5:54292977`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr5:54293330`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr5:54293333`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr5:54293459`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,C21,C3,C35,D6
`Chr5:54295833`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810682.1

383 aa

192

383

CTP_transf_like

PF01467 CTP_transf_like 215-378 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810682.1`	Pfam	`PF01467`	CTP_transf_like	Domain	215	378	2.3e-10	41.5	Cytidylyltransferase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954699.1
ATTTCTTTCGTAGACATCAATTATTAGTTATAACAAATGTTGTTACCATAAACCATTTGTATTAATTTTATTCAGTTTCTACCCAAGTTAATGTCCGGCATCAAATTATCAATCACGTCGGTCGATGAAAAATACTGCTCACTAATTTACTAATTAGGCATTAGCAACCCGAAACGACATCGTTTAACGAGCAAGCAGACGGTGGTGGAGGCCTTCTTGCAATCCGACAGCCTAATATGGACGCTTCCGCACGAGCGATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025092
ATGGACGCTTCCGCACGAGCGATGGTGGAGGCCATCCACGCCACTCCCACTCAGGCCGTACTCTATTTCGCCGGCGGCGCATCTCAGGCGCTCGGGTGGCTGATGTCTGTACCGGGAGCTTCGAACACTGTTCTAGAAGCAGTTGTGCCGTATTCTAGAATGTCCCTGGTCCAGTTACTCGGCAAGGTTCCAGCTCAATTCGCCAGTCGACAGACTGCGGAGGACATGGCGTTGATGGCGTACAATAGAGCTACAGTGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810682.1
MDASARAMVEAIHATPTQAVLYFAGGASQALGWLMSVPGASNTVLEAVVPYSRMSLVQLLGKVPAQFASRQTAEDMALMAYNRATVLSNPGFPALGVGFSGSLASSRPKLGDHRFHVSTRTSDHLWSSTVTLSKGKRTREQEDKVSSQFVLKAIAYACKVPTTFISELTDSEVPDEHKVQFNEDQELKQLINGEICFKVYPFSSDLSTAERKIILSGSFNPLHEGHLKLLEVAESILGEGYPCFELSAVNADKPPLTVSQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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