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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004033`

染色体: Chr05 坐标: 54310165-54311880 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004033`
名称	SmilChr05G004033
描述	E3 ubiquitin-protein ligase MBR2-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	54310165 - 54311880 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025096`
GeneID	`131025096`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025096`
原始查询	`SmilChr05G004033`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	E3 ubiquitin-protein ligase MBR2-like
产物	E3 ubiquitin-protein ligase MBR2-like
Arabidopsis	`AT1G73760` (AT1G73760) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843711] identity=31.7; qcov=1.03; evalue=1.92e-42; confidence=low
Rice	`Os05g0550000` (OsRFPH2-20) - identity=54.7; qcov=0.434; evalue=1.39e-37; confidence=low
GO	GO:0061630 (ubiquitin protein ligase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00097 (zf-C3HC4); PF13639 (zf-RING_2); PF13923 (zf-C3HC4_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025096

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057810687.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057810687.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057810687.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810687.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810687.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:54310503`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B6,B8,C19,C67
`Chr5:54310555`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B134,B4,B99,C59,C87
`Chr5:54310574`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,B93,C71
`Chr5:54310583`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr5:54310680`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr5:54310682`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr5:54311404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B17,B30,C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810687.1

295 aa

148

295

zf-C3HC4_2

zf-RING_2

zf-C3HC4

PF13923 zf-C3HC4_2 244-285 aa PF13639 zf-RING_2 244-286 aa PF00097 zf-C3HC4 245-285 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810687.1`	Pfam	`PF13923`	zf-C3HC4_2	Domain	244	285	1.5e-06	28.6	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057810687.1`	Pfam	`PF13639`	zf-RING_2	Domain	244	286	9e-12	45.8	Ring finger domain
`XP_057810687.1`	Pfam	`PF00097`	zf-C3HC4	Domain	245	285	5.5e-05	23.7	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954704.1
TGTCATTGCAAAGCTAGAACATGGACAAAAAAACAAAAAACATTGCATAAGATAGACAACTGTATTATTTTTTTAAACACCACTTTTTTTCCCTATCACCTCAAATTTTCAAGATTGTTTGTTTCCTTTCAAACCCCTGTCTTAATTCAAAAAATTCACTCACTATTCTTCTCATTTCATTCTCTAGTAAGTGGCTAATGTGAATCATGCCTCAAGTGAAGAAAGAGCACAAGAGATGCAGAAAACAAGAAAACCAGCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025096
ATGCCTCAAGTGAAGAAAGAGCACAAGAGATGCAGAAAACAAGAAAACCAGCAACACTCTTTTTCAGCATCCAATGCAGCAGCAGCTGAATCAAGAATCCCATCCAAGAAGAAGAGGTTCATGTTTGTGAAGCTTAAAGGGCTGGGGTGTAAAGGGACGCCGGTGACGGCGGCGTCGACGCCGGCGATCATACGATCGGCGGCGGATTGGGAGTCTAAGGGTGCAAGAAATCAGACAAATCAGAATAAGAAGAAGAAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810687.1
MPQVKKEHKRCRKQENQQHSFSASNAAAAESRIPSKKKRFMFVKLKGLGCKGTPVTAASTPAIIRSAADWESKGARNQTNQNKKKKRKQPLHSRRNVDNVVVDVPDVCCTPPGIGIASDVAPRARNHAPHRKHSREARRNNDDATQEFPAVLSVGIGSRTAHRSAEEIIEMLMTRQALLPGRILRRHDQYQDWRLDVDDMTYEELLNLGDRIGYVGTGLQEEDISNCVRKFNHDSAHAHGKDWECSICQEKCRVDDEIGI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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