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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004048`

染色体: Chr05 坐标: 54447100-54449730 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004048`
名称	SmilChr05G004048
描述	uncharacterized SmilChr05G004048
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	54447100 - 54449730 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025110`
GeneID	`131025110`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025110`
原始查询	`SmilChr05G004048`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GINS complex protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838490]; symbol=TTN10; hit=AT1G19080; species=arabidopsis; confidence=high
产物	GINS complex protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838490]; symbol=TTN10; hit=AT1G19080; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G19080` (TTN10) GINS complex protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838490] identity=58.9; qcov=0.989; evalue=1.01e-76; confidence=high
Rice	`Os08g0274700` (PSF3) - identity=55.4; qcov=0.995; evalue=6.72e-71; confidence=high
GO	GO:0000811 (GINS complex); GO:1902975 (mitotic DNA replication initiation)
KEGG	-
Pfam	PF05916 (Sld5); PF22466 (PSF3_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025110

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810703.1`
2	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057810703.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810703.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810703.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057810703.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:54447501`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B1,B2,B48
`Chr5:54447597`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B22,C44,C45
`Chr5:54447865`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B96,C32,C68
`Chr5:54448560`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C50,C62
`Chr5:54448562`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B120
`Chr5:54448562`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B120
`Chr5:54448873`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C22,C35
`Chr5:54449145`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr5:54449154`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810703.1

187 aa

187

PSF3_N

Sld5

PF22466 PSF3_N 5-57 aa PF05916 Sld5 75-168 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810703.1`	Pfam	`PF22466`	PSF3_N	Domain	5	57	1.9e-12	47.6	PSF3 N-terminal domain
`XP_057810703.1`	Pfam	`PF05916`	Sld5	Domain	75	168	2.8e-11	44.2	GINS complex protein helical bundle domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954720.1
TAATAATAATAAAAAAAAATAGAATTTGTATCATGTTTCTTCCAAATCTGAAGTCCTTGGCGGCAAAAGGGAAAATTCAGACTACCAGATTCAACACTTTTGCTGGCTGCTACTGTTACTATCTCTCTCTCACTCTCTCAACACACGCAATTTGTGAATGTGTTCGCCTCGTTCACTTATCAATTTGTATAAGGATTCGAGTCACTTAAATCCTCAGTCGTTTAGGTCTCTTTATAGGGCAATTTCAATTTATTTCGTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025110
ATGGCTAATTATTATGACATCGATGATATATTAGCTGAGGAAGAGCTTGTCCCAACCGTGTTCCAACATGCTGCCAATGGGGTTGGGCTCTTTGATTCAAGCGACGATGCAGATAAGGTGGAAGCTGGTTCGAGAGCCGAGCTGCCATTCTGGCTGGTTCGTGAATTGTATTTGAGACAGCTTATATCTATAAGGGTTCCTCCGTGTTTTGATAGAGAATCTAAAACAAGAGAAGAAATAGCAGCTGATGCTGCCCATGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810703.1
MANYYDIDDILAEEELVPTVFQHAANGVGLFDSSDDADKVEAGSRAELPFWLVRELYLRQLISIRVPPCFDRESKTREEIAADAAHVDLRSRSPYFYELGCKIALLISDRTIGPFLLVAFRTRYRDVLVKAHTLTLTMTPKYLTLLTNEETKLYEAGQSSIAAFKKWRMGGPRFQVAPVLGRKRKPT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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