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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004061`

染色体: Chr05 坐标: 54558446-54561576 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004061`
名称	SmilChr05G004061
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	54558446 - 54561576 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025124`
GeneID	`131025124`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025124`
原始查询	`SmilChr05G004061`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=27.6; qcov=1; evalue=3.05e-56; confidence=low
Rice	`Os06g0166100` - identity=37.8; qcov=0.805; evalue=4.26e-80; confidence=medium
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF10551 (MULE); PF21056 (ZSWIM1-3_RNaseH-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025124

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057810726.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057810726.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810726.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810726.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810726.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:54559344`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B60,C30,C39
`Chr5:54559353`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,C12,C32,C68
`Chr5:54559356`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B133,B60,C24,C30,C39
`Chr5:54559382`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	13	A14,A9,B131,B133,B27,B40,B48,B60,C10,C3,C30,C46,C51
`Chr5:54559389`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	110	A15,A20,A22,A4,A6,A8,B10,B103,B106,B108,B109,B11,B114,B117,B118,B119,B120,B123,B125,B129,B13,B131,B132,B133,B135,B137,B139,B16,B17,B22,B23,B27,B30,B33,B34,B42,B43,B46,B47,B50,B55,B56,B6,B60,B64,B66,B71,B73,B75,B76,B79,B8,B83,B84,B89,B91,B96,B97,B98,B99,C11,C13,C14,C15,C16,C17,C19,C2,C23,C24,C26,C27,C28,C3,C30,C32,C34,C35,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C45,C48,C49,C5,C50,C52,C55,C56,C6,C60,C62,C67,C68,C69,C72,C73,C75,C76,C77,C81,C82,C84,D2,D6,D9
`Chr5:54559391`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A14,A21,A9,B104,B131,B133,B27,B4,B40,B48,B60,B69,B86,C10,C3,C30,C46,C51
`Chr5:54559422`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	21	A9,B104,B112,B133,B136,B26,B32,B4,B40,B48,B60,B69,B78,B86,C10,C30,C35,C46,C75,D10,D2
`Chr5:54559427`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	21	A14,A9,B133,B136,B26,B32,B4,B40,B48,B60,B69,B78,B86,C1,C10,C30,C35,C46,C75,D10,D2
`Chr5:54559429`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	23	A14,A9,B104,B112,B133,B136,B26,B32,B4,B40,B48,B60,B69,B78,B86,C1,C10,C30,C35,C46,C75,D10,D2
`Chr5:54559432`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	23	A14,A9,B104,B112,B133,B136,B26,B4,B40,B48,B60,B69,B78,B86,C1,C10,C30,C35,C46,C51,C75,D10,D2
`Chr5:54559433`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	24	A14,A9,B104,B112,B133,B136,B25,B26,B4,B40,B48,B60,B69,B78,B86,C1,C10,C30,C35,C46,C51,C75,D10,D2
`Chr5:54559439`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	25	A14,A21,A9,B104,B112,B133,B136,B25,B26,B4,B40,B48,B60,B69,B78,B86,C1,C10,C30,C35,C46,C51,C75,D10,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810726.1

401 aa

200

401

ZSWIM1-3_RNaseH-like

MULE

PF21056 ZSWIM1-3_RNaseH-like 87-194 aa PF10551 MULE 111-205 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810726.1`	Pfam	`PF21056`	ZSWIM1-3_RNaseH-like	Domain	87	194	5e-07	30.4	Zinc finger SWIM domain-containing protein 1/3, RNaseH-like domain
`XP_057810726.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	111	205	5.7e-27	94.7	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954743.1
TAATTAAAATGAGTTAAGACGGTGAAGTGTAATTTTCCGACGAGAAGATTGTGACGAGAAAGTATAGAAATGAGCTTAGACTTGAACAGAGGTTATGGTAGTGACGAACTTGTCGAAAACTTAAGTGGCAATGTTAGTGATTCCTTAGGTGAAAGGGATGGATTGGGTTACAGAAATGCGGCTGTGGAGACTGATATTGATGATGGGGAGGGCGAAGAAGATGCGGATGGGGAGATAGCCCGATCCCATGAAGGAAATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025124
ATGTCAAGGACGAAGAAGAATTTGCTTATTTCTATGCGTGCCAGTGGAATTGGAGTTAGCCGCGCTTATCGTTTTTTGGAGAACGAAGCTGGAAGTCGGCAAAATGTTGGTTTCATACGGAAGGATGTATACAATGAACTGCATCGTGAAAGTCGCAATGTATCGAAGATTAACAACGGTGATGCGAATAGCTTAGTGCAGTATTTCACTGAGAAGGGAATGAGTGATCCTTCATTCTATTGGAAGTTGAAGCTCAGTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810726.1
MSRTKKNLLISMRASGIGVSRAYRFLENEAGSRQNVGFIRKDVYNELHRESRNVSKINNGDANSLVQYFTEKGMSDPSFYWKLKLSDEGRLEHLFFRDCRYLIDYQHFGDVVSIDVTYKMNKYDLICVPIIGINHHRTNVMFGMGFLCNEKTESYEWLFRTFLESMYKKQPGVIFSDQDMALMNALDYTFTEASHRLCQWHINKNAVKHFGKLNHDREFKTLWFRCMKGCESEEQFEECWRRMIEEHNLSKNKWFSNMYV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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