当前解析结果
SmilChr05G004074| 统一新 Gene ID | SmilChr05G004074 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G004074 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G004074 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 54638847 - 54640091 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131025137 |
|---|---|
| GeneID | 131025137 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025137 |
| 原始查询 | SmilChr05G004074 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025137 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057810736.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057810736.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057810736.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057810736.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057810736.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:54639440 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C3 |
Chr5:54639448 |
C |
CTT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 5 | B127,B66,C34,C52,C82 |
Chr5:54639448 |
C |
CTT |
2bp_insertion | CDS_variant | 5 | B127,B66,C34,C52,C82 |
Chr5:54639453 |
T |
TG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 2 | B66,C34 |
Chr5:54639453 |
T |
TG |
1bp_insertion | CDS_variant | 2 | B66,C34 |
Chr5:54639456 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B127,C52 |
Chr5:54639456 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B127,C52 |
Chr5:54639469 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B117,C30 |
Chr5:54639481 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 18 | A18,B18,B25,B3,B47,B56,B6,B8,B85,B96,B97,C17,C4,C55,C62,C67,C77,C87 |
Chr5:54639616 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B1 |
Chr5:54639616 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B1 |
Chr5:54639634 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C35,D5 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。