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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004077`

染色体: Chr05 坐标: 54647293-54648868 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004077`
名称	SmilChr05G004077
描述	probable ribose-5-phosphate isomerase 2
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	54647293 - 54648868 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025140`
GeneID	`131025140`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025140`
原始查询	`SmilChr05G004077`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable ribose-5-phosphate isomerase 2
产物	probable ribose-5-phosphate isomerase 2
Arabidopsis	`AT2G01290` (RPI2) ribose-5-phosphate isomerase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814657] identity=64.4; qcov=0.951; evalue=3.82e-122; confidence=high
Rice	`Os07g0176900` (P0534H07.29-1) - identity=65; qcov=0.824; evalue=1.84e-106; confidence=high
GO	GO:0004751 (ribose-5-phosphate isomerase activity); GO:0009052 (pentose-phosphate shunt, non-oxidative branch)
KEGG	smil00030 (Pentose phosphate pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00710 (Carbon fixation by Calvin cycle - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF06026 (Rib_5-P_isom_A)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025140

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057810741.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057810741.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810741.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810741.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810741.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:54647504`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B10,B128,B83,B9,C38,C71
`Chr5:54647523`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,C17
`Chr5:54647548`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B138,C31,C82,D1
`Chr5:54647586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,B26,B61
`Chr5:54647587`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B128,B83,C38
`Chr5:54647600`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:54647662`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:54648015`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B15
`Chr5:54648027`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr5:54648059`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B12,B18,B37
`Chr5:54648134`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B30,C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810741.1

284 aa

142

284

Rib_5-P_isom_A

PF06026 Rib_5-P_isom_A 82-257 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810741.1`	Pfam	`PF06026`	Rib_5-P_isom_A	Family	82	257	9.5e-60	201.8	Ribose 5-phosphate isomerase A (phosphoriboisomerase A)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954758.1
AATAATTTGATTTCACATCTTCAAACTAGAAACTCGTCCAATTTCAAAACTCATGAGCCCTCCAAAAGTCTGAAGCAAACACCATCCAACACTAAAAAAAAACTAAAAAGAGTCCTACACTTCTTGGAAAAAATTAATAATAAATGATTTCACATTTTCAAACTAGAAAATAGTGATTTCCAAGAAGCAACGTATAGAAATAGTCACCCCAAAAATATGCTGCAGTATCCCACACTCTCATCTAATTAACTATGTTGTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025140
ATGGCAGCAGCCTATCCACATTTCCTAGTATCCGAAACCCTAACCGCGGCCACGCCGCCGCCGATAATGGCGACCCCCGCCGCCTCGCCCCTCACGCAGGACGAATTGAAGAAGATCGCCGCCTACAAAGCCGTCGAGCACGTGCGTTCCGGCATGGTCGTCGGCCTCGGCACCGGCTCCACCGCGAAGCACGCCGTCGACCGCATCGCCGAGCTCCTGAAGCAGGGGAAGCTAAGCGACGTCGTCGGGATCGCCACCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810741.1
MAAAYPHFLVSETLTAATPPPIMATPAASPLTQDELKKIAAYKAVEHVRSGMVVGLGTGSTAKHAVDRIAELLKQGKLSDVVGIATSTKTYEQAASLGIPLSDLDAHPIVDLSIDGADEVDPDLNLVKGRGGSLLREKMVESASRKFIVIVDESKLVSHIGGSGLAMPVEVIPFCWSHSLSRLKALFADAGCVAKLRTGGGGEAYVSDNGNFIIDLYFEREIGDLNEASDRILRLPGIVEHGMFIGLASSVIVAGVNGVT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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