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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004107`

染色体: Chr05 坐标: 54926705-54928500 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004107`
名称	SmilChr05G004107
描述	uncharacterized SmilChr05G004107
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	54926705 - 54928500 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025168`
GeneID	`131025168`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025168`
原始查询	`SmilChr05G004107`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820354]; symbol=AT3G11810; hit=AT3G11810; species=arabidopsis; confidence=high
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820354]; symbol=AT3G11810; hit=AT3G11810; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G11810` (AT3G11810) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820354] identity=45.6; qcov=1.01; evalue=2.79e-85; confidence=high
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF29520 (DUF8558)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025168

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057810781.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057810781.1`
3	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057810781.1`
4	Vacuole membrane	液泡膜	0.40000	`XP_057810781.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810781.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:54927454`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr5:54927491`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr5:54927599`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr5:54927778`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr5:54927914`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B57,B71,C2,C45
`Chr5:54927980`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B30,B42,B43,C35
`Chr5:54927989`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B2,B84,C47,D4
`Chr5:54928003`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B55,D4
`Chr5:54928119`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr5:54928226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B1,B2,B84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810781.1

327 aa

164

327

DUF8558

PF29520 DUF8558 76-297 aa

XP_057810782.1

327 aa

164

327

DUF8558

PF29520 DUF8558 76-297 aa

XP_057810783.1

327 aa

164

327

DUF8558

PF29520 DUF8558 76-297 aa

XP_057810784.1

327 aa

164

327

DUF8558

PF29520 DUF8558 76-297 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810781.1`	Pfam	`PF29520`	DUF8558	Domain	76	297	6.3e-20	72.4	Domain of unknown function (DUF8558)
`XP_057810782.1`	Pfam	`PF29520`	DUF8558	Domain	76	297	6.3e-20	72.4	Domain of unknown function (DUF8558)
`XP_057810783.1`	Pfam	`PF29520`	DUF8558	Domain	76	297	6.3e-20	72.4	Domain of unknown function (DUF8558)
`XP_057810784.1`	Pfam	`PF29520`	DUF8558	Domain	76	297	6.3e-20	72.4	Domain of unknown function (DUF8558)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954798.1
AATCAATAAGATAGCACGAAAGTTGGACTCAGCTCAGAAATTGTTTATATCCGCTGCCATCTCTCCACTTCATCGTCTTCTCGAATCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACAGAAAGCCTGAAACTTCACCTCCGGCATCCATGTCAGCACACAGCCTAAACCTCTGCGGAGTGCTCTCCGAGACCAAGCGCATAATCAATGCTCACTCCCGCCATTTCTTGGCGCTCTCAGTTCTCTTCCTCCTCCCCCTCTCCTTCTC...

XM_057954800.1
AATCAATAAGATAGCACGAAAGTTGGACTCAGCTCAGAAATTGTTTATATCCGCTGCCATCTCTCCACTTCATCGTCTTCTCGAATCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACAGAAAGCCTGAAACTTCACCTCCGGCATCCATGTCAGCACACAGCCTAAACCTCTGCGGAGTGCTCTCCGAGACCAAGCGCATAATCAATGCTCACTCCCGCCATTTCTTGGCGCTCTCAGTTCTCTTCCTCCTCCCCCTCTCCTTCTC...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131025168
ATGTCAGCACACAGCCTAAACCTCTGCGGAGTGCTCTCCGAGACCAAGCGCATAATCAATGCTCACTCCCGCCATTTCTTGGCGCTCTCAGTTCTCTTCCTCCTCCCCCTCTCCTTCTCTCTCGTCGTCTACCCTTCCCTCTCTCACTCCCCTTCGCCCCTCTCCCACTACCACCGCTCCCTCTTCTTCTTCTCCTCGCCGGACCTCCCACCCATCGCCAGATCCCACTTCATCCTCGCAACTGCCTACGCCCTCTTCGT...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057810781.1
MSAHSLNLCGVLSETKRIINAHSRHFLALSVLFLLPLSFSLVVYPSLSHSPSPLSHYHRSLFFFSSPDLPPIARSHFILATAYALFVAFLSLCATASITHSTFHGFYGRPVKFVSSIKYVLISFLPLIGTLIISKFIMGLIAFGFGGFTMMVYNALALIGVEIDYTNLYFLGFVALITALLLGVLIYLQVEWCLSFVIVVVESKWGFAALRRSASLVRGMRGVALCLILLFESLLGLLGLLCSTVVPSAGGLSSRDWISW...

XP_057810782.1
MSAHSLNLCGVLSETKRIINAHSRHFLALSVLFLLPLSFSLVVYPSLSHSPSPLSHYHRSLFFFSSPDLPPIARSHFILATAYALFVAFLSLCATASITHSTFHGFYGRPVKFVSSIKYVLISFLPLIGTLIISKFIMGLIAFGFGGFTMMVYNALALIGVEIDYTNLYFLGFVALITALLLGVLIYLQVEWCLSFVIVVVESKWGFAALRRSASLVRGMRGVALCLILLFESLLGLLGLLCSTVVPSAGGLSSRDWISW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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