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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004110`

染色体: Chr05 坐标: 54943741-54945304 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004110`
名称	SmilChr05G004110
描述	uncharacterized SmilChr05G004110
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	54943741 - 54945304 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025170`
GeneID	`131025170`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025170`
原始查询	`SmilChr05G004110`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os06g0523701` - identity=36; qcov=0.465; evalue=4.28e-43; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	PF24964 (DUF7769)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025170

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810788.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057810788.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810788.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810788.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057810788.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:54944202`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr5:54944301`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr5:54944343`	`A`	`AT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	1	A20
`Chr5:54944343`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A20
`Chr5:54944346`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr5:54944374`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr5:54944381`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,A8,B52
`Chr5:54944403`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,C8
`Chr5:54944416`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,C43,C60,C9
`Chr5:54944450`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,D6
`Chr5:54944488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B51
`Chr5:54944508`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B61,C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810788.1

454 aa

227

454

DUF7769

PF24964 DUF7769 9-62 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810788.1`	Pfam	`PF24964`	DUF7769	Domain	9	62	7e-11	42.3	Domain of unknown function (DUF7769)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954805.1
AAATGGCTATAGAAAGGCCAAAGTTAGAAGATGATCAAAGAAACAAAGTTGCCCAGTGGCTGTTAGAGCATAGCAGTGAAGGCAAACTTCGCCATGGAGCAAAAAAAGAGGCGGCACTTCACTTCAAAGTAAACTTGAAGACCATTTGGAGGATTTGGAGCCATGTCTCCAATCAAAGAGCATCCGGTGTACCTGTCCAGGTTAAATCAATTAGAAAAGGATGTATACACAAGGATAAGATGCTCATTGATGGTGAAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025170
ATGGCTATAGAAAGGCCAAAGTTAGAAGATGATCAAAGAAACAAAGTTGCCCAGTGGCTGTTAGAGCATAGCAGTGAAGGCAAACTTCGCCATGGAGCAAAAAAAGAGGCGGCACTTCACTTCAAAGTAAACTTGAAGACCATTTGGAGGATTTGGAGCCATGTCTCCAATCAAAGAGCATCCGGTGTACCTGTCCAGGTTAAATCAATTAGAAAAGGATGTATACACAAGGATAAGATGCTCATTGATGGTGAAAAAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810788.1
MAIERPKLEDDQRNKVAQWLLEHSSEGKLRHGAKKEAALHFKVNLKTIWRIWSHVSNQRASGVPVQVKSIRKGCIHKDKMLIDGEKVKKLSVLERSTLRCMSTHLGVSKSLLHQWVKEKKLKPHTNAIKPFLTTQNKLCRLRWSLKQLSGVSEDGFIPFQSMYNTIHIDEKWFYLTKTNDRYYLLPDEEEPHRTCKSKRHIEKIMFMCAAARPIIDEDGTVIFDGKLGIYPFITTEPAQRNSKNRVKGTLEVKAIAAITK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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