当前解析结果
SmilChr05G004131| 统一新 Gene ID | SmilChr05G004131 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G004131 |
| 描述 | NAC domain-containing protein 2-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 55291880 - 55293424 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131025191 |
|---|---|
| GeneID | 131025191 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025191 |
| 原始查询 | SmilChr05G004131 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | NAC domain-containing protein 2-like |
| 产物 | NAC domain-containing protein 2-like |
| Arabidopsis | AT1G69490 (NAP)NAC-like, activated by AP3/PI [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843282] identity=64.3; qcov=0.833; evalue=2.68e-103; confidence=high |
| Rice | Os07g0566500 (NAC010)- identity=64.3; qcov=0.74; evalue=1.06e-81; confidence=high |
| GO | GO:0003677 (DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF02365 (NAM) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025191 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057810816.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057810816.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057810816.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057810816.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057810816.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:55292273 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B5,C17,C21,C3,C77 |
Chr5:55292276 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B1,B35,D1 |
Chr5:55292461 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C24 |
Chr5:55293132 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B102,B104,B15,B58 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057810816.1PF02365
NAM 11-135 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057810816.1 |
Pfam | PF02365 |
NAM | Family | 11 | 135 | 2.2e-50 | 170.9 | No apical meristem (NAM) protein |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。