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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004136`

染色体: Chr05 坐标: 55350517-55351365 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004136`
名称	SmilChr05G004136
描述	uncharacterized SmilChr05G004136
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	55350517 - 55351365 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026140`
GeneID	`131026140`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026140`
原始查询	`SmilChr05G004136`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108]; symbol=AT3G09510; hit=AT3G09510; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108]; symbol=AT3G09510; hit=AT3G09510; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09510` (AT3G09510) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108] identity=26.8; qcov=0.596; evalue=6.51e-12; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=27.6; qcov=0.603; evalue=4.59e-09; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026140

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057811892.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057811892.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057811892.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811892.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811892.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:55350521`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B102,B114,B52,B75,C38,C51,C56,C65,C81
`Chr5:55350529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B124,C20
`Chr5:55350548`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B100,B14,C43,C75
`Chr5:55350552`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A11,A19,A5,B101,B137,B42,B43,B58,B64,B66
`Chr5:55350606`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	30	A14,A25,A5,A8,B101,B113,B122,B131,B136,B18,B24,B36,B37,B5,B52,B67,B68,B77,B85,B90,B92,C28,C35,C59,C61,C69,C76,C77,C78,C86
`Chr5:55350607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,A21,B2,C27,D5
`Chr5:55350618`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	C31,C80
`Chr5:55350618`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	C31,C80
`Chr5:55350621`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A15,A5,B27,B61,C55,C65
`Chr5:55350627`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B27,D5
`Chr5:55350627`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,D5
`Chr5:55350638`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	B25,B30,B39,B67,B95,B97,B99,C19,C24,C26,C29,C33,C54,C6,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811892.1

282 aa

141

282

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 83-177 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811892.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	83	177	2.3e-14	54.5	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955909.1
ATGGGAGAAAAACCTCTTTCTATTCGTTTCCCAAGATTGTTTCATCTCAGCGAGAATAAGGAGGCGCTTGTGAGTGAGCTGGGTAATTGGGAGAACGGGAGGTGGGTGTGGGATTTGAGGTGGAGACGAGATCTTTTTGAGAGGGAGAAGGAGGCTGTTAATTCCCTACTTTCTTGTATTTCTGGTTGTGTTTTTCATGCAGGTGAAGTTGATGGATGGATTTGGAAGAAGACCAAGGAAGGCAAATACACAACAAAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026140
ATGGGAGAAAAACCTCTTTCTATTCGTTTCCCAAGATTGTTTCATCTCAGCGAGAATAAGGAGGCGCTTGTGAGTGAGCTGGGTAATTGGGAGAACGGGAGGTGGGTGTGGGATTTGAGGTGGAGACGAGATCTTTTTGAGAGGGAGAAGGAGGCTGTTAATTCCCTACTTTCTTGTATTTCTGGTTGTGTTTTTCATGCAGGTGAAGTTGATGGATGGATTTGGAAGAAGACCAAGGAAGGCAAATACACAACAAAATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811892.1
MGEKPLSIRFPRLFHLSENKEALVSELGNWENGRWVWDLRWRRDLFEREKEAVNSLLSCISGCVFHAGEVDGWIWKKTKEGKYTTKSAYLVIQATRKENSTPNVSLKTAAKVWDIQAVQKARVTVWRAFRNRLPTCENLRKRSIGIDEMEMFCNACFEPVESTDHSLICCPKALAIWDGLLKWIGVQMAHPQGLHEHFSIFCQMAKDKKSRKFLKSLWVCTIWILWRKKNERRFEGTGWDDFGTIMEIISSMWSWNKIFN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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