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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004139`

染色体: Chr05 坐标: 55365107-55366963 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004139`
名称	SmilChr05G004139
描述	uncharacterized SmilChr05G004139
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	55365107 - 55366963 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026142`
GeneID	`131026142`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026142`
原始查询	`SmilChr05G004139`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859]; symbol=MUG7; hit=AT3G05850; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859]; symbol=MUG7; hit=AT3G05850; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=23.5; qcov=0.997; evalue=7.69e-43; confidence=weak
Rice	`Os12g0597300` - identity=27.6; qcov=0.592; evalue=1.53e-33; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026142

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811894.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811894.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811894.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811894.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811894.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:55365162`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr5:55365166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B26,B37
`Chr5:55365185`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B134,B28,B30,B77,C84
`Chr5:55365204`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,B97,D4
`Chr5:55365209`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B24,B62,B69,C27
`Chr5:55365215`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,C75
`Chr5:55365218`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B138,B18,C36,C57,C84
`Chr5:55365234`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C16
`Chr5:55365239`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B82,C16,C54
`Chr5:55365243`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B60
`Chr5:55365244`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B18,B72,C29,C5
`Chr5:55365244`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B18,B72,C29,C5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811894.1

618 aa

309

618

Transposase_mut

MULE

PF00872 Transposase_mut 427-527 aa PF10551 MULE 428-522 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811894.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	427	527	3.8e-11	43.2	Transposase, Mutator family
`XP_057811894.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	428	522	6.4e-21	75.3	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955911.1
ATGTCGTTTCAAGCAATCGTTATACGGCACAGTGGTCAGTGGAAATTAACCGAGTATGAAGGAGGCGATGAGGTTGTCGTGTACATGTCTAAGGAAGACCTTTGTCATGCGAAGTTGATGCAAGAGGTGCACGATCAATTAAACGAGGATGATCGATCCACTTATATGCTTTTCTACACATCGACCACGGACGAAGGGCGAAGAATAAAAGTGGCTTTGAAGACTGATTCGGATTTGAACCGGCTGATTTCCGAGCACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026142
ATGTCGTTTCAAGCAATCGTTATACGGCACAGTGGTCAGTGGAAATTAACCGAGTATGAAGGAGGCGATGAGGTTGTCGTGTACATGTCTAAGGAAGACCTTTGTCATGCGAAGTTGATGCAAGAGGTGCACGATCAATTAAACGAGGATGATCGATCCACTTATATGCTTTTCTACACATCGACCACGGACGAAGGGCGAAGAATAAAAGTGGCTTTGAAGACTGATTCGGATTTGAACCGGCTGATTTCCGAGCACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811894.1
MSFQAIVIRHSGQWKLTEYEGGDEVVVYMSKEDLCHAKLMQEVHDQLNEDDRSTYMLFYTSTTDEGRRIKVALKTDSDLNRLISEHKKYPVVYVIEKGKQSAAPVPQTQERVYYEGHRSTMFPIETDIGRSIPTHDDSRDDSSSQEEEDESESSDEEEEAIRRREILDSVSTEQEAWRQTGPQNFTSDDQPDVEPRVGVQQLEARDWGIPVLDFDDAPALGWEDSNVLESGILSVGALFRSKDDLAIAVGLYHMENHVEY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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