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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004147`

染色体: Chr05 坐标: 55405320-55407634 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004147`
名称	SmilChr05G004147
描述	myb family transcription factor PHL8-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	55405320 - 55407634 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025202`
GeneID	`131025202`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025202`
原始查询	`SmilChr05G004147`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	myb family transcription factor PHL8-like
产物	myb family transcription factor PHL8-like
Arabidopsis	`AT1G69580` (AT1G69580) Homeodomain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843294] identity=53; qcov=0.722; evalue=2.11e-40; confidence=medium
Rice	`Os03g0325500` - identity=48.7; qcov=0.727; evalue=4.52e-37; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF14379 (Myb_CC_LHEQLE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025202

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810832.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810832.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810832.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810832.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057810832.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:55405776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:55405980`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	83	A11,A14,A2,A20,A3,A4,A8,B1,B100,B103,B109,B11,B113,B114,B117,B120,B131,B133,B139,B14,B140,B16,B18,B21,B25,B28,B30,B31,B34,B36,B37,B44,B45,B47,B53,B59,B6,B62,B64,B65,B67,B70,B75,B82,B89,B9,B91,C11,C13,C16,C18,C19,C20,C21,C22,C25,C27,C29,C3,C30,C35,C36,C39,C42,C45,C47,C53,C55,C56,C57,C6,C61,C65,C67,C69,C70,C73,C76,C77,C86,C9,D4,D7
`Chr5:55405996`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,B71,B78,C2
`Chr5:55406060`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B5
`Chr5:55406060`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B5
`Chr5:55406076`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B39,C52,D7
`Chr5:55406426`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B10
`Chr5:55406433`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B10
`Chr5:55406434`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr5:55406558`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D11
`Chr5:55406558`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:55406596`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B86,B90,B92,C1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810832.1

300 aa

150

300

Myb_DNA-binding

Myb_CC_LHEQLE

PF00249 Myb_DNA-binding 91-142 aa PF14379 Myb_CC_LHEQLE 177-223 aa

XP_057810833.1

209 aa

104

209

Myb_CC_LHEQLE

PF14379 Myb_CC_LHEQLE 86-132 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810832.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	91	142	2.1e-05	25.2	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057810832.1`	Pfam	`PF14379`	Myb_CC_LHEQLE	Family	177	223	1.7e-19	70.0	MYB-CC type transfactor, LHEQLE motif
`XP_057810833.1`	Pfam	`PF14379`	Myb_CC_LHEQLE	Family	86	132	1e-19	70.7	MYB-CC type transfactor, LHEQLE motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954849.1
AGGGAACGTGCCTTTCTCTCTTTTCACCCGACCCCCCCCCCCCCCCCCCCGCAGAATTACGCCCCAAGTGCGCACCGGGGAGTGGTAGCAACAGCGAGGATCTCTAATTTTGTCATTTTGGTACGTTCACAAATATCAATCCCTTTCTTTTTTTTGAAAACTTTCTATGACAGGATGGATCCCTTTCTCCACTCATAATATTGTTAACACTATTTTTTTTAAGTCTCAACTCACAATACTCTCGACTATTTTATCAAAAT...

XM_057954850.1
TGCTTTTCAGTGCAAGCATCACAGATTCTCTCCAATCTTCCAAGTCAAACAACAGAATAAACAAAGTACACTATCCACAAATGAGAGATGAGAGAGAAAGTAAAAGAGCCACAGCTCATGGCATATATTCCCTTACATATATAATAAAACAACATACACACTACATGCATGTCTCAAACTTAGCTACCTTAAAAAACAAGAAAATTTTACTAATGTACAACAACAACAACAACAAGATGAGGCTGCTTCTATCAAGCGAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131025202
ATGCTTTTCAGTGCAAGCATCACAGATTCTCTCCAATCTTCCAAGTCAAACAACAGAATAAACAAAGTACACTATCCACAAATGAGAGATGAGAGAGAAAGTAAAAGAGCCACAGCTCATGGCATATATTCCCTTACATATATAATAAAACAACATACACACTACATGCATGTCTCAAACTTAGCTACCTTAAAAAACAAGAAAATTTTACTAATGTACAACAACAACAACAACAAGATGAGGCTGCTTCTATCAAGCGA...

LOC131025202
ATGGACGTCGGAGCTCCACCACCAGTTCGTCGCCGCCGTCGACCGCCTCGGCGGCGCTCACAGTTTAAAGCAACGCCTAAATCTCTGATGAGGATCATGGCCGTTGATGGCCTCACTTTGTACCATCTCAAGAGCCATTTGCAGAAATATAGGATGGGAAGGAGCCACCAAAATAAGCAACAAAACTCTGGTGAGAAAACGAGCCGTCACTCTACCAACAAGACCACCCGCGACAGCTCTACTACAGGAAATTTGCAGAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057810832.1
MLFSASITDSLQSSKSNNRINKVHYPQMRDERESKRATAHGIYSLTYIIKQHTHYMHVSNLATLKNKKILLMYNNNNNKMRLLLSSDAKPRLRWTSELHHQFVAAVDRLGGAHKATPKSLMRIMAVDGLTLYHLKSHLQKYRMGRSHQNKQQNSGEKTSRHSTNKTTRDSSTTGNLQMTMALQMQMEVQRKLHEQIEVQKDLQLRVEAQGKYLQRVVRKAQETISEYGSCSIEAEHARAQLAELASMVDSVESSLTSSSE...

XP_057810833.1
MDVGAPPPVRRRRRPPRRRSQFKATPKSLMRIMAVDGLTLYHLKSHLQKYRMGRSHQNKQQNSGEKTSRHSTNKTTRDSSTTGNLQMTMALQMQMEVQRKLHEQIEVQKDLQLRVEAQGKYLQRVVRKAQETISEYGSCSIEAEHARAQLAELASMVDSVESSLTSSSEASTQRCQLRERSFLSLSLHPEESIDLNCTKSVPKFIDLNS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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