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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004152`

染色体: Chr05 坐标: 55453426-55456801 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004152`
名称	SmilChr05G004152
描述	uncharacterized SmilChr05G004152
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	55453426 - 55456801 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025208`
GeneID	`131025208`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025208`
原始查询	`SmilChr05G004152`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	P0643D11.22-2; symbol=P0643D11.22-2; hit=Os09g0413600; species=rice; confidence=medium
产物	P0643D11.22-2; symbol=P0643D11.22-2; hit=Os09g0413600; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G39785` (AT5G39785) - identity=39.1; qcov=0.607; evalue=1.09e-79; confidence=medium
Rice	`Os09g0413600` (P0643D11.22-2) - identity=43.5; qcov=0.57; evalue=1.28e-86; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07891 (DUF1666)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025208

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810844.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057810844.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057810844.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810844.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810844.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:55454304`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C39
`Chr5:55454385`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B138,B44,B51,B52,B81
`Chr5:55454385`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B138,B44,B51,B52,B81
`Chr5:55454391`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	A6,B128,B63,B94,C34,C85,D2
`Chr5:55454504`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B2
`Chr5:55454721`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr5:55454795`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B20,B80,C58
`Chr5:55454855`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B133,B18,C25
`Chr5:55455005`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:55455514`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B110,C75,C76
`Chr5:55455521`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr5:55455523`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810844.1

661 aa

330

661

DUF1666

PF07891 DUF1666 423-661 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810844.1`	Pfam	`PF07891`	DUF1666	Family	423	661	7.6e-76	255.8	Protein of unknown function (DUF1666)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954861.1
AAAAAAGAAAAAGGAATTCAATTCCTACAAAATTAAAACCCCAAATATCAAGCATGATGCTAGACGCAAAGATTCCTAATTCTCTCCTATCTCCCAAAATTAACTATTTCTATTCTTTACAATAATTCTTTTTCACCTCTATTAGTTGAAAACTCAGATTCTTCTCCACCAATTTAGCCGTCCCACAAGTGCTCTTTCCACTTAATAATTTCCCCAATCAAAATCAAAATTCCACTATATATATATTCGAGTGCTCATAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025208
ATGTTTAGTTTCTGTAGTATTTTCTTGGCTTCTCTGTGTAGTTTGATGCTCAAGATTCTTGGCCTCATTCACAAACACATATACATATCAAAATCGAGTCTTGCTGAAGATAAAGATGAGAGCTCTGTTTCGTTTCAGAGCGGTTTAGTTTCTAAAAATAGTAAGTGCCAAATTTTGTCTGGTAATAATAATGTGAGTGGATTCTTGGAAGAGCCCAAGACAGCAGTGGGATTTGTGGTCCAAGAATTGTTTGTCGGAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810844.1
MFSFCSIFLASLCSLMLKILGLIHKHIYISKSSLAEDKDESSVSFQSGLVSKNSKCQILSGNNNVSGFLEEPKTAVGFVVQELFVGEDNVVVSSDQSEKIMGFEQSYEEKSVEFDQKSDFSSPFYFKLFNPNSPFSNEEKSSEMEKTVSLVGVYGEEEEEEEVDFRVEEDEEFAYEIELIPSSHSSTLSADQESDGDRDCAAAPEKVEKNDWMSSFLDEVDHENEASFDDDEFIEVEPQCVKLSDELDLDLDRGSDDSCS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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