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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004164`

染色体: Chr05 坐标: 55545558-55547314 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004164`
名称	SmilChr05G004164
描述	40S ribosomal protein S9-2
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	55545558 - 55547314 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025219`
GeneID	`131025219`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025219`
原始查询	`SmilChr05G004164`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein S9-2
产物	40S ribosomal protein S9-2
Arabidopsis	`AT5G39850` (AT5G39850) Ribosomal protein S4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833981] identity=89.84; qcov=0.949; evalue=5.62e-126; confidence=high
Rice	`Os03g0154700` (OsRPS9-2) - identity=91.8; qcov=0.929; evalue=1.03e-124; confidence=high
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0019843 (rRNA binding); GO:0022627 (cytosolic small ribosomal subunit); GO:0045903 (positive regulation of translational fidelity)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00163 (Ribosomal_S4); PF01479 (S4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025219

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五折投票；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，投票比例不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057810859.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057810859.1`
3	Nucleolus	核仁	0.40000	`XP_057810859.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:55546291`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D10
`Chr5:55546291`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D10
`Chr5:55546310`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B3,B31,B42,B43,C85
`Chr5:55546346`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B93
`Chr5:55546348`	`A`	`AT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	148	A1,A10,A11,A13,A14,A18,A20,A24,A25,A3,A5,A6,A7,B10,B100,B102,B103,B104,B105,B106,B111,B114,B117,B119,B121,B122,B126,B127,B128,B129,B131,B133,B134,B135,B139,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B23,B24,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B35,B36,B37,B38,B39,B40,B45,B47,B5,B50,B51,B52,B53,B58,B59,B6,B62,B63,B64,B66,B68,B69,B7,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B8,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B89,B9,B90,B91,B92,B96,B98,B99,C10,C12,C14,C18,C19,C27,C28,C30,C31,C33,C34,C35,C4,C41,C42,C46,C48,C49,C5,C52,C54,C55,C56,C58,C59,C6,C60,C62,C63,C64,C66,C67,C68,C69,C72,C75,C76,C77,C80,C81,C82,C83,C84,C87,D10,D3,D4,D7,D8
`Chr5:55546400`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B4,B61,B7,C3
`Chr5:55546499`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,C29
`Chr5:55546509`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr5:55546511`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr5:55547063`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A2
`Chr5:55547063`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810859.1

197 aa

197

Ribosomal_S4

PF00163 Ribosomal_S4 8-108 aa PF01479 S4 109-153 aa

XP_057810860.1

138 aa

138

Ribosomal_S4

PF00163 Ribosomal_S4 8-108 aa PF01479 S4 109-137 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810859.1`	Pfam	`PF00163`	Ribosomal_S4	Family	8	108	8.5e-15	55.9	Ribosomal protein S4/S9 N-terminal domain
`XP_057810859.1`	Pfam	`PF01479`	S4	Domain	109	153	1.9e-12	47.4	S4 domain
`XP_057810860.1`	Pfam	`PF00163`	Ribosomal_S4	Family	8	108	3.6e-15	57.1	Ribosomal protein S4/S9 N-terminal domain
`XP_057810860.1`	Pfam	`PF01479`	S4	Domain	109	137	3.4e-07	30.6	S4 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954876.1
CTGAAGCCCAATAATGTTAATAACAGACCTCTTTACCCATTAGGGTTTTGGCCCCAAAAGAGATGAGTATAAATTGCACTCTCAAATTATTCGGAACCCTAACTCCCATTACCACCGCGACCAGCCACAGCAGAGAGCAGATCGGCGGACTGACGGCGGCGGAGGAGGCCAGTAACCATGGTGCACGTCTCGTTTTACCGCAATTATGGGAAGACATTCAAGAAGCCTCGTCGTCCTTATGAGAAGGAGCGACTCGATGC...

XM_057954877.1
GTTTTGGCCCCAAAAGAGATGAGTATAAATTGCACTCTCAAATTATTCGGAACCCTAACTCCCATTACCACCGCGACCAGCCACAGCAGAGAGCAGATCGGCGGACTGACGGCGGCGGAGGAGGCCAGTAACCATGGTGCACGTCTCGTTTTACCGCAATTATGGGAAGACATTCAAGAAGCCTCGTCGTCCTTATGAGAAGGAGCGACTCGATGCTGAGCTAAAGCTTGTTGGAGAGTATGGTTTGAGGTGCAAAAGGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080391.1_cds_XP_057810859.1_30121
ATGGTGCACGTCTCGTTTTACCGCAATTATGGGAAGACATTCAAGAAGCCTCGTCGTCCTTATGAGAAGGAGCGACTCGATGCTGAGCTAAAGCTTGTTGGAGAGTATGGTTTGAGGTGCAAAAGGGAGCTATGGAGGGTTCAGTATGCCTTGAGCCGCATTAGGAATAATGCTAGAAACCTTTTGACCCTTGATGAAAAGGATCCCCGTCGTATTTTCGAGGGTGAGGCCCTTCTGAGGAGGATGAACAGGTATGGTCT...

lcl|NC_080391.1_cds_XP_057810860.1_30122
ATGGTGCACGTCTCGTTTTACCGCAATTATGGGAAGACATTCAAGAAGCCTCGTCGTCCTTATGAGAAGGAGCGACTCGATGCTGAGCTAAAGCTTGTTGGAGAGTATGGTTTGAGGTGCAAAAGGGAGCTATGGAGGGTTCAGTATGCCTTGAGCCGCATTAGGAATAATGCTAGAAACCTTTTGACCCTTGATGAAAAGGATCCCCGTCGTATTTTCGAGGGTGAGGCCCTTCTGAGGAGGATGAACAGGTATGGTCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057810859.1
MVHVSFYRNYGKTFKKPRRPYEKERLDAELKLVGEYGLRCKRELWRVQYALSRIRNNARNLLTLDEKDPRRIFEGEALLRRMNRYGLLDESQNKLDYVLSLTVENFLERRLQTLVFKAGMAKSIHHARVLIRQRHIRVGRQVVNVPSFLVRVDSQKHIDFSLTSPFGGGRPGRVKRKNQKAAAKKASGGDGDEDDEE

XP_057810860.1
MVHVSFYRNYGKTFKKPRRPYEKERLDAELKLVGEYGLRCKRELWRVQYALSRIRNNARNLLTLDEKDPRRIFEGEALLRRMNRYGLLDESQNKLDYVLSLTVENFLERRLQTLVFKAGMAKSIHHARVLIRQRHIRY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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