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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004165`

染色体: Chr05 坐标: 55550417-55552191 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004165`
名称	SmilChr05G004165
描述	40S ribosomal protein S9-2
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	55550417 - 55552191 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025220`
GeneID	`131025220`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025220`
原始查询	`SmilChr05G004165`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein S9-2
产物	40S ribosomal protein S9-2
Arabidopsis	`AT5G39850` (AT5G39850) Ribosomal protein S4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833981] identity=89.8; qcov=0.949; evalue=5.62e-126; confidence=high
Rice	`Os03g0154700` (OsRPS9-2) - identity=91.8; qcov=0.929; evalue=1.03e-124; confidence=high
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0019843 (rRNA binding); GO:0022627 (cytosolic small ribosomal subunit); GO:0045903 (positive regulation of translational fidelity)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00163 (Ribosomal_S4); PF01479 (S4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025220

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057810861.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057810861.1`
3	Nucleolus	核仁	0.40000	`XP_057810861.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810861.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810861.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:55550617`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr5:55551159`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B42
`Chr5:55551249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr5:55551354`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B40,B87
`Chr5:55551829`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr5:55551946`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	B36,B6,C10,C19,C26,C67,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810861.1

197 aa

197

Ribosomal_S4

PF00163 Ribosomal_S4 8-108 aa PF01479 S4 109-153 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810861.1`	Pfam	`PF00163`	Ribosomal_S4	Family	8	108	8.5e-15	55.9	Ribosomal protein S4/S9 N-terminal domain
`XP_057810861.1`	Pfam	`PF01479`	S4	Domain	109	153	1.9e-12	47.4	S4 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954878.1
AATCTGAAGCCCAATAATGTTAATAACAAACCTTCTTTACCCATTAGGGTTTTGGCCCCAAAAGAGATGAGTATAAATTGCACCTCAAATTATTCGGAACCCTAACTCCCATTACCACCGCGATCAGCCACAGCAGAGAGCACATCGGCGGACTGACGGCGGCGGAGGAGGCCAGTAACCATGGTGCACGTCTCATTTTACCGCAATTATGGGAAGACATTCAAGAAGCCTCGTCGTCCTTATGAGAAGGAGCGACTCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025220
ATGGTGCACGTCTCATTTTACCGCAATTATGGGAAGACATTCAAGAAGCCTCGTCGTCCTTATGAGAAGGAGCGACTCGATGCTGAGCTAAAGCTTGTTGGAGAGTATGGTTTGAGGTGCAAAAGGGAGCTATGGAGGGTTCAGTATGCCTTGAGCCGGATTAGGAATAATGCTAGAAATCTTTTGACCCTTGATGAGAAGGATCCCCGTCGTATTTTCGAGGGTGAGGCCCTTCTGAGGAGGATGAACAGGTATGGTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810861.1
MVHVSFYRNYGKTFKKPRRPYEKERLDAELKLVGEYGLRCKRELWRVQYALSRIRNNARNLLTLDEKDPRRIFEGEALLRRMNRYGLLDESQNKLDYVLSLTVENFLERRLQTLVFKAGMAKSIHHARVLIRQRHIRVGRQVVNVPSFLVRVDSQKHIDFSLTSPFGGGRPGRVKRKNQKAAAKKASGGDGDEDDEE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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