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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004174`

染色体: Chr05 坐标: 55676818-55678021 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004174`
名称	SmilChr05G004174
描述	transcription termination factor MTEF1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	55676818 - 55678021 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025231`
GeneID	`131025231`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025231`
原始查询	`SmilChr05G004174`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription termination factor MTEF1, chloroplastic
产物	transcription termination factor MTEF1%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT2G36000` (EMB3114) Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818173] identity=55.2; qcov=0.804; evalue=3.44e-92; confidence=high
Rice	`Os03g0785200` - identity=43; qcov=0.758; evalue=9.94e-56; confidence=medium
GO	GO:0003690 (double-stranded DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF02536 (mTERF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025231

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057810878.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057810878.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810878.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810878.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810878.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:55676989`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr5:55677015`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,D5
`Chr5:55677061`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr5:55677202`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr5:55677264`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A10,A15
`Chr5:55677264`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A10,A15
`Chr5:55677280`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A10,A15
`Chr5:55677280`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	A10,A15
`Chr5:55677282`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A10,A15
`Chr5:55677282`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A10,A15
`Chr5:55677284`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	A10,A15
`Chr5:55677284`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	2	A10,A15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810878.1

322 aa

161

322

mTERF

PF02536 mTERF 57-175 aa PF02536 mTERF 187-293 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810878.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	57	175	1.4e-39	136.6	mTERF
`XP_057810878.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	187	293	1.4e-39	136.6	mTERF

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954895.1
ACAGATGAAATATATTTTATTAATTTTTAATTTTTATGTGGTTTGCAGATAACACACGCCCCTCTCCACCTTATCTCTTTCCACTCCCTCTCCAAACAATGTAGCAACTATGCAAGAAACTCTCCACCTCTCCTCCTCCTCCTCCGCCGCCGCCGCCGCTACTCCCCTCCCCCTCAATTCCCCTTCAATCCCCCGCCCCAAACACCTCCAATTTCCACCCCATTCCTCCACCAAAGCCCCCAGCATTCCCCTCCCTCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025231
ATGCAAGAAACTCTCCACCTCTCCTCCTCCTCCTCCGCCGCCGCCGCCGCTACTCCCCTCCCCCTCAATTCCCCTTCAATCCCCCGCCCCAAACACCTCCAATTTCCACCCCATTCCTCCACCAAAGCCCCCAGCATTCCCCTCCCTCCTCCGCCCATTTCTCCGGCCGCATCGGAAACTTCCCAAATCCAAGAAATCATCCTCTACTTGGACTCCCTCGGCGTCGACTCCTTCTACTGCCTCCACACCCACCCGCCGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810878.1
MQETLHLSSSSSAAAAATPLPLNSPSIPRPKHLQFPPHSSTKAPSIPLPPPPISPAASETSQIQEIILYLDSLGVDSFYCLHTHPPLISTPVSQIKSTVDFLLSLGITVADLRRIFPMCPELLTSSSTAVRATTFLLREARVGAADLRYVVHRRPRLLACSVERQLRPALYFLQGTIGIEDVSRFTFLLSCSVESKFIPRIDYLQKLGFPYRDAILMFRRFPSLFCYSIKENFEPKFDYFVVEMGRELKELVAFPHYFSF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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