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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004183`

染色体: Chr05 坐标: 55733666-55735035 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004183`
名称	SmilChr05G004183
描述	F-box protein At1g11270-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	55733666 - 55735035 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025238`
GeneID	`131025238`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025238`
原始查询	`SmilChr05G004183`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein At1g11270-like
产物	F-box protein At1g11270-like
Arabidopsis	`AT3G17710` (AT3G17710) F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821038] identity=29.27; qcov=0.658; evalue=2.95e-14; confidence=low
Rice	`Os12g0164300` (OsFbox646) - identity=32.92; qcov=0.433; evalue=3.04e-14; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025238

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057810889.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057810889.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:55733825`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr5:55733857`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C56
`Chr5:55733857`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C56
`Chr5:55733870`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B32,B54,C53,C9
`Chr5:55733899`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B13,B131,C31
`Chr5:55734040`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B50,B94,C41,C48
`Chr5:55734207`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr5:55734247`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B80,C58
`Chr5:55734288`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr5:55734320`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B13,B131,C31
`Chr5:55734327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr5:55734490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810889.1

342 aa

171

342

F-box-like

F-box

PF12937 F-box-like 7-41 aa PF00646 F-box 8-44 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810889.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	7	41	2.9e-07	30.8	F-box-like
`XP_057810889.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	8	44	1.2e-09	38.4	F-box domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954906.1
AAGATAAAATAAAAAATTAATACTAGTATTTATTTAAACAGAAATTATAAATTCGCATTGCAACTGTTTTGGGCTAAGTAAAGGGGCACTCAGCCCACTCTTTCCACAAGCTCCGCATTTAATGGGTTCACGCACGCATGCTTTGAAGATTTGCACATACAGTATATATATGAGAAAAGGAAAAATCAAATTCGTATATAAACCCTAGAATTGAATCCTCCGCCGCAGCCATGGATGGAATCCAGAACTATCTTCCGCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080391.1_cds_XP_057810889.1_30151
ATGGATGGAATCCAGAACTATCTTCCGCATGATGTCATCGAAGGCATCCTCTCCCGATTGCCGGTGAAGTCTCTCCTCCGATTCAAGTGCGTATGCAAGCAGTGGAGCGCCACCATCTCCGCCCCCAAATTCGCCCAAACTCATCTCCGGCGATCCAAAAACTCATCATCAACGATTCTACTTGTAGATCTGGAAAATTCTCCCGAAAAAGCTCAACTCGTCGATCTGGAAACCGAACAATTCCGACACTCAGCCGTCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810889.1
MDGIQNYLPHDVIEGILSRLPVKSLLRFKCVCKQWSATISAPKFAQTHLRRSKNSSSTILLVDLENSPEKAQLVDLETEQFRHSAVDYPVEVSVADVMCHCDGLYVLWCSDRGYALWNPSRRSYKMLNYQQYRFDHDQLMCGICYDPLVEDYNVVMADSTHYAVFHCRRNCWSDLKELNLSITIRYDVDDASGLPLKNGSIYWLRCVWGEGEVLRYEIVYFDGRDEEMKILCKADGDSFPVRMISSGECLRFFARDWDDQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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