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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004184`

染色体: Chr05 坐标: 55741109-55743495 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004184`
名称	SmilChr05G004184
描述	uncharacterized SmilChr05G004184
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	55741109 - 55743495 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026151`
GeneID	`131026151`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026151`
原始查询	`SmilChr05G004184`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=26.7; qcov=0.754; evalue=3.88e-53; confidence=low
Rice	`Os06g0704400` - identity=34.5; qcov=0.774; evalue=1.92e-100; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF03108 (DBD_Tnp_Mut); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026151

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811903.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811903.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811903.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811903.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811903.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:55741121`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B102,B46,B8,B84,C29,C5,C75
`Chr5:55741169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B119,B134,C3,C8
`Chr5:55741172`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A8,B117,B35,B46,C39,C56
`Chr5:55741175`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	56	A20,A23,A4,A8,A9,B104,B118,B119,B12,B120,B122,B126,B134,B16,B20,B25,B27,B34,B50,B53,B55,B57,B67,B69,B78,B87,B94,B97,C11,C15,C2,C23,C27,C28,C3,C40,C42,C45,C46,C50,C51,C53,C54,C62,C63,C69,C70,C73,C74,C76,C78,C79,C8,C81,C84,D6
`Chr5:55741196`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	A1,A21
`Chr5:55741196`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	2	A1,A21
`Chr5:55741258`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,D10
`Chr5:55741309`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	33	A20,A8,A9,B100,B119,B120,B134,B16,B25,B34,B53,B55,B69,B78,B97,C13,C2,C23,C27,C28,C3,C40,C43,C46,C53,C63,C69,C73,C74,C79,C8,C81,C84
`Chr5:55741334`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B86
`Chr5:55741334`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86
`Chr5:55741356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:55741409`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A8,B117,B129,B16,B46,B6,C39,C56,C67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811903.1

745 aa

372

745

DBD_Tnp_Mut

MULE

Transposase_mut

SWIM

PF03108 DBD_Tnp_Mut 63-127 aa PF10551 MULE 256-351 aa PF00872 Transposase_mut 274-407 aa PF04434 SWIM 503-532 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811903.1`	Pfam	`PF03108`	DBD_Tnp_Mut	Family	63	127	2.8e-06	27.6	MuDR family transposase
`XP_057811903.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	256	351	6.1e-15	56.1	MULE transposase domain
`XP_057811903.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	274	407	8.7e-06	25.6	Transposase, Mutator family
`XP_057811903.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	503	532	8.5e-10	38.7	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955920.1
ATGGAGGAACTACAAAGGCTTATTGTAGAATATGTACCACCTGATCTTCATAATGTAGAGGAGCAACAATCTGAGTATGAAGTTTCAGATGGGGATGTGCATTCCGATGAAACTGATGAGGATAGGGATTTGGGTAAGTCTAGCATAAGCAGAGTAGTTTATGATCCAAAGTGTGATCACAAAGAACTACAAATAGTTATTGGGATGATGTTTCAGGATGGATGGCAACGCAGGAGTGCTTTAACTTCATATTCCATAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026151
ATGGAGGAACTACAAAGGCTTATTGTAGAATATGTACCACCTGATCTTCATAATGTAGAGGAGCAACAATCTGAGTATGAAGTTTCAGATGGGGATGTGCATTCCGATGAAACTGATGAGGATAGGGATTTGGGTAAGTCTAGCATAAGCAGAGTAGTTTATGATCCAAAGTGTGATCACAAAGAACTACAAATAGTTATTGGGATGATGTTTCAGGATGGATGGCAACGCAGGAGTGCTTTAACTTCATATTCCATAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811903.1
MEELQRLIVEYVPPDLHNVEEQQSEYEVSDGDVHSDETDEDRDLGKSSISRVVYDPKCDHKELQIVIGMMFQDGWQRRSALTSYSIENGKFIQFRRVSKRQCEARCIPPCEWKVYASVVKEDQSFCIKRYRGYHSCPRAMSNKLLTSKWVAMKYLNVFRVRPELSIAELRADIVTRFKYDLPKDRLYKAKFIAKELVRGTVEHYYGQLRRYIAELRRVDREGRFELLLGDNVVFRGLYMGFSSLIKGFKRSCRPLIGLDG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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