当前解析结果
SmilChr05G004194| 统一新 Gene ID | SmilChr05G004194 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G004194 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G004194 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 55820332 - 55821366 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131026153 |
|---|---|
| GeneID | 131026153 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131026153 |
| 原始查询 | SmilChr05G004194 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0587600; species=rice; confidence=weak |
| 产物 | hit=Os03g0587600; species=rice; confidence=weak |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os03g0587600- identity=66.7; qcov=0.096; evalue=8.94e-09; confidence=weak |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131026153 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057811904.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057811904.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057811904.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057811904.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057811904.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:55820351 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C77 |
Chr5:55820555 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C87 |
Chr5:55820658 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D8 |
Chr5:55820664 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A4,C41 |
Chr5:55820665 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D8 |
Chr5:55820673 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B101,C74 |
Chr5:55820689 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A4,C41 |
Chr5:55820700 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C52 |
Chr5:55820755 |
ACT |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 13 | B108,B133,B17,B25,B36,B67,B92,C14,C15,C20,C3,C38,C53 |
Chr5:55820765 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B30,B76 |
Chr5:55820775 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B29,C25 |
Chr5:55820777 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B133,B36,C14,C20 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。