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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004207`

染色体: Chr05 坐标: 55961538-55962816 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004207`
名称	SmilChr05G004207
描述	classical arabinogalactan protein 4-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	55961538 - 55962816 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026158`
GeneID	`131026158`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026158`
原始查询	`SmilChr05G004207`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	classical arabinogalactan protein 4-like
产物	classical arabinogalactan protein 4-like
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026158

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811909.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057811909.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811909.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811909.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811909.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:55961551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr5:55961556`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C25
`Chr5:55961563`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:55961573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B48,B77,B81
`Chr5:55961574`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:55961619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B58,B62,C37,C75
`Chr5:55961629`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	136	A1,A10,A11,A14,A16,A18,A19,A2,A23,A24,A25,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B10,B100,B102,B103,B105,B109,B111,B114,B117,B119,B120,B123,B124,B129,B13,B132,B134,B135,B136,B137,B14,B16,B18,B19,B20,B23,B26,B27,B29,B33,B34,B35,B36,B4,B40,B42,B43,B45,B46,B5,B53,B56,B59,B62,B66,B67,B70,B71,B72,B74,B75,B76,B79,B80,B81,B84,B85,B88,B89,B9,B90,B92,B93,B94,B96,B97,B98,B99,C1,C11,C16,C17,C18,C19,C20,C21,C23,C27,C33,C34,C37,C41,C42,C44,C45,C46,C49,C5,C51,C53,C54,C55,C57,C59,C60,C61,C62,C63,C64,C66,C67,C69,C70,C72,C74,C76,C77,C78,C80,C81,C82,C83,C84,C87,C9,D11,D3,D4,D8
`Chr5:55961684`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	B114,B122,B22,B30,B7,B87,B97,C15,C25,C76,D9
`Chr5:55961697`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	100	A11,A13,A18,A22,A24,A5,A7,A8,A9,B105,B106,B110,B111,B112,B114,B117,B118,B121,B122,B124,B127,B128,B13,B131,B133,B135,B136,B137,B139,B140,B15,B17,B18,B19,B21,B22,B24,B25,B27,B28,B29,B32,B37,B40,B42,B43,B49,B54,B55,B57,B58,B59,B6,B60,B62,B67,B68,B7,B72,B75,B82,B85,B86,B87,B88,B9,B97,B99,C12,C14,C15,C22,C25,C30,C31,C4,C48,C50,C52,C57,C6,C60,C61,C63,C67,C69,C7,C71,C73,C76,C78,C8,C83,C84,C9,D3,D5,D7,D8,D9
`Chr5:55961704`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	101	A11,A13,A18,A22,A24,A5,A7,A8,A9,B105,B106,B110,B111,B112,B114,B117,B118,B121,B122,B124,B127,B128,B13,B131,B133,B135,B136,B137,B139,B140,B15,B17,B18,B19,B21,B22,B24,B25,B27,B28,B29,B32,B37,B39,B40,B42,B43,B49,B54,B55,B57,B58,B59,B6,B60,B62,B67,B68,B7,B72,B75,B82,B85,B86,B87,B88,B9,B97,B99,C12,C14,C15,C22,C25,C30,C31,C4,C48,C50,C52,C57,C6,C60,C61,C63,C67,C69,C7,C71,C73,C76,C78,C8,C83,C84,C9,D3,D5,D7,D8,D9
`Chr5:55961713`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B32,C53
`Chr5:55961714`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955926.1
ATGGGGAAATTGTGGGATGGGGTTTCCTTGGATTTGAGGAACCAATTTTGGGAGATTAGATTCTTCTTCAGCGCCGCAATCCTCTATCTTCCCCCGGCGGCACTGCCTGGAAAAACCCCCCCAACCGCGCCGTCGCCATCCCTGGCCCACGCGGTCTCCCCTGCTTCGGCAGCATCCTCACCCTCCGCCGCGGCCGCGCGCATCGCTCCCTCGCCTCCACCGCCTCCGCCCTCAACGCCACCGGCCTCGCGCACCGCTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026158
ATGGGGAAATTGTGGGATGGGGTTTCCTTGGATTTGAGGAACCAATTTTGGGAGATTAGATTCTTCTTCAGCGCCGCAATCCTCTATCTTCCCCCGGCGGCACTGCCTGGAAAAACCCCCCCAACCGCGCCGTCGCCATCCCTGGCCCACGCGGTCTCCCCTGCTTCGGCAGCATCCTCACCCTCCGCCGCGGCCGCGCGCATCGCTCCCTCGCCTCCACCGCCTCCGCCCTCAACGCCACCGGCCTCGCGCACCGCTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811909.1
MGKLWDGVSLDLRNQFWEIRFFFSAAILYLPPAALPGKTPPTAPSPSLAHAVSPASAASSPSAAAARIAPSPPPPPPSTPPASRTAPSAHPVYRPAPQPHIVTSFSLSLPGTESATAPAVMDSDLDPQPQWAAEKHFFSAEFMGVMQEIIRKEVRNYMVGMEMEKKGQYMQSDAMMINSVIKRMRMSKVD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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