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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004208`

染色体: Chr05 坐标: 55962707-55964686 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004208`
名称	SmilChr05G004208
描述	probable galacturonosyltransferase-like 9
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	55962707 - 55964686 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025259`
GeneID	`131025259`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025259`
原始查询	`SmilChr05G004208`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable galacturonosyltransferase-like 9
产物	probable galacturonosyltransferase-like 9
Arabidopsis	`AT1G70090` (LGT8) glucosyl transferase family 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843345] identity=72.5; qcov=0.909; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0739400` - identity=66.1; qcov=0.858; evalue=3.64e-149; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01501 (Glyco_transf_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025259

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057810917.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810917.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810917.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810917.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810917.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:55963090`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,C47,C73,D3
`Chr5:55963230`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr5:55963369`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,B9
`Chr5:55963435`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:55963729`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr5:55963846`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr5:55963852`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr5:55963896`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	26	B101,B108,B112,B117,B122,B128,B132,B133,B25,B26,B28,B5,B81,B90,B92,C1,C12,C2,C33,C39,C52,C6,C65,C8,C80,D3
`Chr5:55963905`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr5:55963924`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,C34
`Chr5:55963938`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B74
`Chr5:55963938`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810917.1

372 aa

186

372

Glyco_transf_8

PF01501 Glyco_transf_8 66-327 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810917.1`	Pfam	`PF01501`	Glyco_transf_8	Family	66	327	3e-53	181.7	Glycosyl transferase family 8

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954934.1
TCCACGTATTTAGTCACCAAATTTCTTTATTTCTTTATTCCCAAAAATTAGCAACTACCAACCGCTGCAAATAAAGAAATTCAATCAAGTTCACCGGCGCGTGGGCGATTTAATCAACTCACCCTTCATCAGCCGGCGCGTGGGTATCCCGCACACTGTTCTTTTTTTTTTTTTTTAATTCGAATTTTAATGCCGTAATTAGAGTGTGTTGAAATAATTTAATTTATTGAAGAAATAATTTGTTTGTGATTTTGTTTGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025259
ATGATTCTTCTTCCGAAATTAATCGCCGCGGCGGCCGGGATCCTCATTCTCCTCCTCCTCCGGGCGCCGGAGTGCGGCGCCATCCGCGCCTTCCCCGACGGCGTCGGCGGATTCGCCGAGGCGCCGGAGTACCGCAACGGCGAGGGCTGCGCCGCGGCGGCGGCGCCGTCGGCGTCGTGCGATCCCTCGCTGGTGCACGTGGCGATGACGCTGGACTCGGAGTACCTCCGCGGCACGGTGGCGGCGGTGCACTCGGTCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810917.1
MILLPKLIAAAAGILILLLLRAPECGAIRAFPDGVGGFAEAPEYRNGEGCAAAAAPSASCDPSLVHVAMTLDSEYLRGTVAAVHSVLRHASCPERVSLHFVAAEFDPATPRDLTRLVRAIFPSLRFKVYIFREDAVINLISSSVRAALENPLNYARSYLGELLDPCVKRVIYLDSDLVLVDDVAKLWEIELTGNRVIGAPEYCHANFTKYFTDGFWSDPVLSRAFGSGKKPCYFNTGVMVMDLERWREGHFRNKIENWME...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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