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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004210`

染色体: Chr05 坐标: 55976254-55978002 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004210`
名称	SmilChr05G004210
描述	two-component response regulator ARR3-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	55976254 - 55978002 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025261`
GeneID	`131025261`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025261`
原始查询	`SmilChr05G004210`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	two-component response regulator ARR3-like
产物	two-component response regulator ARR3-like
Arabidopsis	`AT1G59940` (ARR3) response regulator 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842288] identity=72.3; qcov=0.753; evalue=1.57e-69; confidence=high
Rice	`Os11g0143300` (OSRR9) - identity=62; qcov=0.709; evalue=3.2e-53; confidence=high
GO	GO:0000160 (phosphorelay signal transduction system); GO:0009736 (cytokinin-activated signaling pathway)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00072 (Response_reg)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025261

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810922.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057810922.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057810922.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810922.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810922.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:55976509`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr5:55976571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr5:55976950`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr5:55976967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr5:55977390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,B77
`Chr5:55977496`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B22,B73
`Chr5:55977621`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	44	A13,A2,A21,A24,A25,A7,B10,B114,B119,B12,B124,B127,B129,B132,B138,B14,B140,B15,B16,B18,B2,B30,B49,B51,B54,B55,B65,B7,B70,B79,B86,B94,C15,C2,C3,C34,C36,C4,C51,C57,C61,C81,C86,D9
`Chr5:55977622`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	44	A13,A2,A21,A24,A25,A7,B10,B114,B119,B12,B124,B127,B129,B132,B138,B14,B140,B15,B16,B18,B2,B30,B49,B51,B54,B55,B65,B7,B70,B79,B86,B94,C15,C2,C3,C34,C36,C4,C51,C57,C61,C81,C86,D9
`Chr5:55977630`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	46	A13,A2,A21,A24,A25,A7,B10,B114,B119,B12,B124,B127,B129,B132,B138,B14,B140,B15,B16,B18,B2,B27,B30,B49,B51,B54,B55,B65,B68,B7,B70,B79,B86,B94,C15,C2,C3,C36,C4,C51,C57,C61,C81,C86,D3,D9
`Chr5:55977655`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,B63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810922.1

182 aa

182

Response_reg

PF00072 Response_reg 53-171 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810922.1`	Pfam	`PF00072`	Response_reg	Domain	53	171	1.8e-21	77.1	Response regulator receiver domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954939.1
CGGACCATTTTTGACACCTTTACTAACATATAGCACTATATGCTAAAAAAATCACAAATTAAAAGATAGAGTTAGACACAAATCTTGAAAAAAAGTCTCTTGTGATACAGAAAATCGGATCAACGCCATAATAATGATTTCCAGAATCTCAGCCGTATACTTTTTATACACTATGATAACAGATTTCCACCAGACTTTATTTGAATTTTTCATACATAATTTACTATTTATATATATATCTTCACTATATATATATTGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025261
ATGTTCGTTTCTTGTTTTATCTTCCAATATCAGCTGAAGATTCTTTGCAGAAGTTTTGGGTTTTTGGCATTTTTTTTCATTTTCATTTTTCTAGAAATTAAAATGGCCAAAATTAATGGTGAGTTTTCACCATGTTTGGATTCAAATGAAGTTCATGTTCTTGCCGTGGACGACAGTCTTGTTGATCGGAAATTCATCGAAAAATTGCTAAGACTCACTTCTTGCAAAGTGACAGCGGTGGATAGTGGGAGAAGAGCATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810922.1
MFVSCFIFQYQLKILCRSFGFLAFFFIFIFLEIKMAKINGEFSPCLDSNEVHVLAVDDSLVDRKFIEKLLRLTSCKVTAVDSGRRALQYLGLHEEEGSTNYNEIKVDLIITDYCMPGMTGFELLKKIKGSSTFKETPVVIMSSENILARIDRCFEEGAEDFIVKPVKLSDVERLKRSMQGRG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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