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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004222`

染色体: Chr05 坐标: 56064566-56068291 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004222`
名称	SmilChr05G004222
描述	cyclin-D1-1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	56064566 - 56068291 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025269`
GeneID	`131025269`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025269`
原始查询	`SmilChr05G004222`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cyclin-D1-1-like
产物	cyclin-D1-1-like
Arabidopsis	`AT1G70210` (CYCD1;1) CYCLIN D1;1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843357] identity=53.5; qcov=0.997; evalue=2.88e-99; confidence=high
Rice	`Os09g0382300` (CycD1) - identity=45; qcov=0.816; evalue=8.32e-69; confidence=high
GO	GO:0000079 (regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity); GO:0000307 (cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016538 (cyclin-dependent protein serine/threonine kinase regulator activity); GO:0044772 (mitotic cell cycle phase transition)
KEGG	-
Pfam	PF00134 (Cyclin_N); PF02984 (Cyclin_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025269

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810944.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810944.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810944.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810944.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057810944.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:56064774`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B20,C60
`Chr5:56064895`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	B105,B133,B55,B92,C54,C60,C67,C75,C86,D11
`Chr5:56064931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B135,B82,B93
`Chr5:56064948`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	A1,B135,B43,C20,C3
`Chr5:56064948`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	5	A1,B135,B43,C20,C3
`Chr5:56065322`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr5:56067172`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C64,C66,C74
`Chr5:56067413`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B20,B98,C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810944.1

332 aa

166

332

Cyclin_N

Cyclin_C

PF00134 Cyclin_N 71-176 aa PF02984 Cyclin_C 179-291 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810944.1`	Pfam	`PF00134`	Cyclin_N	Domain	71	176	3.9e-26	91.9	Cyclin, N-terminal domain
`XP_057810944.1`	Pfam	`PF02984`	Cyclin_C	Domain	179	291	1.6e-11	45.0	Cyclin, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954961.1
GAAGTGAATCTAAACTGACCAAAAACCTACAGTCTCCCCTCTCACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCACTCTCTTTCTCTCTCCTCTCCCTCACGTTTTCCGGCGGATATATATACCGGCCAATCCGGCGAGACAAAGCTAAATTCCCGTAAAACATGATTCGAAGAGAATGACGAGTCGTCTCCGGCGGTCGAATTCGCCATGTCACTGTCGTCGTGCTCAGACTGCTTCTCCGACCTCCTCTGCGGCGAGGACTCCAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025269
ATGTCACTGTCGTCGTGCTCAGACTGCTTCTCCGACCTCCTCTGCGGCGAGGACTCCAGTAGTATTATCTCCTCCGTCGGCGGAGATTTCTCGCCGGAATACTCATCGGACTTCGATTCTCGGCCGCCGGACGCCGAGGAGTCCATCGCCGGGCTGCTAGAAGACGAGAGAGATCTAGCTATCGTGCGCGGCCGCGCCGTCGATCGGCCCATCGACGCGTCGGTTAGAGCTGAATTTGTTGCATGGATTCTCAAGGTGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810944.1
MSLSSCSDCFSDLLCGEDSSSIISSVGGDFSPEYSSDFDSRPPDAEESIAGLLEDERDLAIVRGRAVDRPIDASVRAEFVAWILKVQCYYGFQPLTGYLSVNYFDRFLYCHQLPKMNGWPLQLLSVACLSLAAKMEERLVPSLLDLQVEDAKFIFEPRTIQRMELLVLRVLDWRLRSISPFCYLPFFALKIDPSGTCTDFLTTRAKEIIFSTIQETSFLECRPSCIAAATILCAANDLPKFSLITAQHAESWCEGLHKDE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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