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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004223`

染色体: Chr05 坐标: 56077470-56083095 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004223`
名称	SmilChr05G004223
描述	protein PLASTID REDOX INSENSITIVE 2, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	56077470 - 56083095 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025271`
GeneID	`131025271`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025271`
原始查询	`SmilChr05G004223`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein PLASTID REDOX INSENSITIVE 2, chloroplastic-like
产物	protein PLASTID REDOX INSENSITIVE 2%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G10522` (PRIN2) Serine/Threonine-kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837593] identity=48.4; qcov=0.574; evalue=3.17e-11; confidence=low
Rice	`Os09g0382400` (PRIN2) - identity=43.3; qcov=0.62; evalue=2.18e-11; confidence=low
GO	GO:0010468 (regulation of gene expression)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025271

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057810946.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057810946.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810946.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810946.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810946.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:56077592`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,B69
`Chr5:56077603`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B44,C2
`Chr5:56078663`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:56078764`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61
`Chr5:56078785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr5:56078798`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C48
`Chr5:56078798`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C48
`Chr5:56079331`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B36,C13,C17

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

8 records

下载 cDNA FASTA

XR_009102122.1
CACATTAGCAGAGCCTTTACCCCTCAGAAATCCAGAATGGCGTCCCTCTGCAATCTCGCCATCCTCCCGCCCGCGTCGTTTCCCGCCAAAAAGCCAGTCGCCGGCGGCGCTGCTATCCTGCGCACTCCTCCGCAATTCCTCGCCGCGAGAAAACTCTCTTCAGTAATTCGGAAAGCTATCCAATCTCAGAGTCGGGAGAAGTACGTCTATCCTGACCCCATCCCTGAATTTGCAGCTGCCGAGACGGAGAAGTTCAAAGC...

XR_009102121.1
CACATTAGCAGAGCCTTTACCCCTCAGAAATCCAGAATGGCGTCCCTCTGCAATCTCGCCATCCTCCCGCCCGCGTCGTTTCCCGCCAAAAAGCCAGTCGCCGGCGGCGCTGCTATCCTGCGCACTCCTCCGCAATTCCTCGCCGCGAGAAAACTCTCTTCAGTAATTCGGAAAGCTATCCAATCTCAGAGTCGGGAGAAGTACGTCTATCCTGACCCCATCCCTGAATTTGCAGCTGCCGAGACGGAGAAGTTCAAAGC...

CDS

6 records

下载 CDS FASTA

LOC131025271
ATGGCGTCCCTCTGCAATCTCGCCATCCTCCCGCCCGCGTCGTTTCCCGCCAAAAAGCCAGTCGCCGGCGGCGCTGCTATCCTGCGCACTCCTCCGCAATTCCTCGCCGCGAGAAAACTCTCTTCAGTAATTCGGAAAGCTATCCAATCTCAGAGTCGGGAGAAGTACGTCTATCCTGACCCCATCCCTGAATTTGCAGCTGCCGAGACGGAGAAGTTCAAAGCTGAATTGCTGAAGAAGCTGTCGAAGCAGAAGGAAAC...

Protein

6 records

下载 Protein FASTA

XP_057810946.1
MASLCNLAILPPASFPAKKPVAGGAAILRTPPQFLAARKLSSVIRKAIQSQSREKYVYPDPIPEFAAAETEKFKAELLKKLSKQKETFGNDLRMVVDVCAEIFGEFLHKDYGGPGTLLIEPFTDMMLALKDKNLAGAALAARASLLWAQNYVDRDWEDWNSKSHE

XP_057810947.1
MASLCNLAILPPASFPAKKPVAGGAAILRTPPQFLAARKLSSVIRKAIQSQSREKYVYPDPIPEFAAAETEKFKAELLKKLSKQKETFGNDLRMVVDVCAEIFGEFLHKDYGGPGTLLIEPFTDMMLALKDKNLAGAALAARASLLWAQNYVDRDWEDWNSKSHE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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