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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004227`

染色体: Chr05 坐标: 56103271-56104851 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004227`
名称	SmilChr05G004227
描述	xyloglucan O-acetyltransferase 2-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	56103271 - 56104851 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026162`
GeneID	`131026162`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026162`
原始查询	`SmilChr05G004227`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	xyloglucan O-acetyltransferase 2-like
产物	xyloglucan O-acetyltransferase 2-like
Arabidopsis	`AT1G70230` (TBL27) TRICHOME BIREFRINGENCE-LIKE 27 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843359] identity=55.6; qcov=0.929; evalue=4.41e-145; confidence=high
Rice	`Os09g0375300` (OsTBL41) - identity=53.6; qcov=0.992; evalue=5.36e-127; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0016413 (O-acetyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF13839 (PC-Esterase); PF14416 (PMR5N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026162

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057811914.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811914.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811914.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811914.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811914.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:56103290`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C37
`Chr5:56103549`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B134,B28,B4,B89,C28,C59
`Chr5:56103552`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	87	A14,A2,A21,A23,A3,A4,A5,A6,A8,B1,B10,B100,B101,B105,B106,B109,B111,B113,B114,B115,B117,B120,B121,B122,B125,B126,B129,B131,B132,B137,B14,B17,B25,B26,B28,B29,B30,B34,B35,B38,B39,B41,B45,B47,B5,B51,B52,B53,B63,B65,B67,B70,B72,B77,B79,B83,B88,B89,B9,B93,B94,B95,C17,C2,C27,C29,C30,C34,C35,C38,C42,C43,C46,C48,C5,C51,C57,C79,C8,C82,C83,C84,C85,C9,D2,D3,D7
`Chr5:56103627`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,C83
`Chr5:56103629`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B61,B88,D10
`Chr5:56103682`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,C20
`Chr5:56103683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A18
`Chr5:56103683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr5:56103712`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,C31
`Chr5:56103732`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr5:56103778`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,B77
`Chr5:56103800`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811914.1

378 aa

189

378

PMR5N

PC-Esterase

PF14416 PMR5N 31-83 aa PF13839 PC-Esterase 84-371 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811914.1`	Pfam	`PF14416`	PMR5N	Domain	31	83	9.4e-20	71.4	PMR5 N terminal Domain
`XP_057811914.1`	Pfam	`PF13839`	PC-Esterase	Family	84	371	2.8e-87	294.0	GDSL/SGNH-like Acyl-Esterase family found in Pmr5 and Cas1p

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955931.1
ATGGGATCATCAAACAATCCTTCTCCCATTGAGGAACATCTATCAGACCATACTGATCATTTCCTTGCAGAAGTTTCTAGAAAAGCACCGCCATGCGACTACGCCGAGGGGGAGTGGGTCCCAAGCGAGACGGCCCCGCTCTACAACGGGACGACGTGCGACACGATCAAACCCGGCCAGAACTGCATGGCGCGAGGCCGGCCCGACCGGGGCTTCCTCTTCTGGAGGTGGCGGCCGAGCCGGTGCGAGCTCCCGGGGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026162
ATGGGATCATCAAACAATCCTTCTCCCATTGAGGAACATCTATCAGACCATACTGATCATTTCCTTGCAGAAGTTTCTAGAAAAGCACCGCCATGCGACTACGCCGAGGGGGAGTGGGTCCCAAGCGAGACGGCCCCGCTCTACAACGGGACGACGTGCGACACGATCAAACCCGGCCAGAACTGCATGGCGCGAGGCCGGCCCGACCGGGGCTTCCTCTTCTGGAGGTGGCGGCCGAGCCGGTGCGAGCTCCCGGGGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811914.1
MGSSNNPSPIEEHLSDHTDHFLAEVSRKAPPCDYAEGEWVPSETAPLYNGTTCDTIKPGQNCMARGRPDRGFLFWRWRPSRCELPGFDPAAFLELVANKHVAFVGDSLARNQLESLLCMTAAAARPRLVYADGEDNKFRRWRIASHNATFSIYWSPFLVRGVEKSAERNFNELFLDSANEIWAADLKDLDVIIFSAGHWFLHTAVYYQNDVVLGCHYCENHTEIGFYGVFGRALQTAFDTVTERGGKTDVILTTFTPAHF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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