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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004230`

染色体: Chr05 坐标: 56117709-56121499 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004230`
名称	SmilChr05G004230
描述	WAT1-related protein At3g28050-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	56117709 - 56121499 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025276`
GeneID	`131025276`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025276`
原始查询	`SmilChr05G004230`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	WAT1-related protein At3g28050-like
产物	WAT1-related protein At3g28050-like
Arabidopsis	`AT3G28050` (UMAMIT41) nodulin MtN21 /EamA-like transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822429] identity=43.6; qcov=1.03; evalue=9.72e-89; confidence=medium
Rice	`Os01g0117900` (OsUMAMIT1) - identity=34.7; qcov=0.946; evalue=1.1e-64; confidence=low
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity)
KEGG	-
Pfam	PF00892 (EamA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025276

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057810958.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057810958.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.40000	`XP_057810958.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810958.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810958.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:56119034`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:56119074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:56119078`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B79,C32,C41,C68
`Chr5:56119414`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr5:56119631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr5:56119694`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,C60,C71
`Chr5:56119745`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70
`Chr5:56119928`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B53,C77
`Chr5:56119967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B125,B22,B37,C82
`Chr5:56120030`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B14,B23
`Chr5:56121163`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	A5,B79,C32,C41,C68
`Chr5:56121163`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	5	A5,B79,C32,C41,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810958.1

350 aa

175

350

EamA

PF00892 EamA 11-151 aa PF00892 EamA 176-312 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810958.1`	Pfam	`PF00892`	EamA	Domain	11	151	3.6e-17	63.6	EamA-like transporter family
`XP_057810958.1`	Pfam	`PF00892`	EamA	Domain	176	312	3.6e-17	63.6	EamA-like transporter family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009102123.1
ATCGCATCCAATGAAATCTAGATACTTACATTTATTCATTCCTCAAATAAAAAACAAAAAGTATTACTAGTAATAATAAAAACGTTTTTTAAAAGTAAAATATTACAAAAAAAAAACGCAAGCTCAATCCCCATAGCATCAGCGGAGTCAACGCGAGTAAGCAGCTCGCGGTCAAAGATTGGGGCGGAGGCGGCGGAGATGGGGCTGCCGGAGCACGCTGCGACACCGTATTTGGGGATGGTGCTGGCTTCAACGGCGCA...

XM_057954975.1
ATCGCATCCAATGAAATCTAGATACTTACATTTATTCATTCCTCAAATAAAAAACAAAAAGTATTACTAGTAATAATAAAAACGTTTTTTAAAAGTAAAATATTACAAAAAAAAAACGCAAGCTCAATCCCCATAGCATCAGCGGAGTCAACGCGAGTAAGCAGCTCGCGGTCAAAGATTGGGGCGGAGGCGGCGGAGATGGGGCTGCCGGAGCACGCTGCGACACCGTATTTGGGGATGGTGCTGGCTTCAACGGCGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025276
ATGGGGCTGCCGGAGCACGCTGCGACACCGTATTTGGGGATGGTGCTGGCTTCAACGGCGCAAGTAGGGCTGATTATCATCAGCAAAAGCGCTCTGGCTTCCGGAATGACTAATTACACCTTCGTAGCTTACTCCAATGCCCTCGCCGCCCTAATTCTTCTTCCTTTATCTCTCCTCGTTCACAGGTCATCAAATCGGCCGCCGCTGACATTCCTGCTTGTTTGTGGGTTTTTTTCGTTAGGAGTTCTTGGGTGTTTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810958.1
MGLPEHAATPYLGMVLASTAQVGLIIISKSALASGMTNYTFVAYSNALAALILLPLSLLVHRSSNRPPLTFLLVCGFFSLGVLGCLAQLTGYTGISYTSAEFASAMLNLIPGFTFVLAVIFRMEVLNCRNSSFLAKTFGTVVSISGAFVVTLYKGPEIFTHLLSANVVAQSRWVIGGLFLTADCVVASAYIIVQASILKKYPAELVVVFFYCFFAAILSTFVSLITDRDLSAWSLQPNIRLIAVLYSGVFGSAFQVGVTS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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