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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004231`

染色体: Chr05 坐标: 56128251-56129974 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004231`
名称	SmilChr05G004231
描述	protein RICE SALT SENSITIVE 3-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	56128251 - 56129974 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025277`
GeneID	`131025277`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025277`
原始查询	`SmilChr05G004231`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein RICE SALT SENSITIVE 3-like
产物	protein RICE SALT SENSITIVE 3-like
Arabidopsis	`AT1G60060` (AT1G60060) Serine/threonine-protein kinase WNK (With No Lysine)-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842300] identity=60.6; qcov=1.02; evalue=4.38e-118; confidence=high
Rice	`Os02g0742700` - identity=55.9; qcov=0.929; evalue=2.19e-107; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14215 (bHLH-MYC_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025277

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810959.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057810959.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057810959.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810959.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810959.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:56128331`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B64,B94,C47
`Chr5:56128444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr5:56128809`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B104,B18,B86,C54
`Chr5:56128825`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B39
`Chr5:56128849`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr5:56128877`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D2
`Chr5:56128877`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D2
`Chr5:56128878`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,B77
`Chr5:56129526`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:56129536`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr5:56129815`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	D5
`Chr5:56129815`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810959.1

312 aa

156

312

bHLH-MYC_N

PF14215 bHLH-MYC_N 16-199 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810959.1`	Pfam	`PF14215`	bHLH-MYC_N	Family	16	199	9.3e-30	105.0	bHLH-MYC and R2R3-MYB transcription factors N-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954976.1
AAATTATTGAAGGAAGAGTAGAAAGAGATACTATCACATTAGATTTTCTTATAAAGAATTAAAAAAAATAAAAAATGGAAGAACATCATCATCTCAATCCTTTGGCTGCAACTCATCTTCTTCAACATACCCTCAGAAGCTTCTGCATTCATCAAAACTCTCAATGGGTCTATGCTGTTTTTTGGAGGATTCTCCCAAGAAATTTTCCACCTCCCATGTGGGATAGTGAAATAGAAGTGCATGACAGGTCTAAAGGGAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025277
ATGGAAGAACATCATCATCTCAATCCTTTGGCTGCAACTCATCTTCTTCAACATACCCTCAGAAGCTTCTGCATTCATCAAAACTCTCAATGGGTCTATGCTGTTTTTTGGAGGATTCTCCCAAGAAATTTTCCACCTCCCATGTGGGATAGTGAAATAGAAGTGCATGACAGGTCTAAAGGGAATAGGAGAAATTGGATATTGGCTTGGGAAGATGGTTTCTGTAATTTTGCAGCTTCAACGGCTGTGATGAACTCCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810959.1
MEEHHHLNPLAATHLLQHTLRSFCIHQNSQWVYAVFWRILPRNFPPPMWDSEIEVHDRSKGNRRNWILAWEDGFCNFAASTAVMNSGESSPPSIYGGDRRLKPEVFFKMSHEIHNYGEGLIGKVAANQSHKWIYKGQNDEEKNSCAWHNLLDSHPRTWEAQFQSGLETIALIAVREGVLQLGAAHKINEELSYVMLVRKKLSYMEKIPGFLLPHPSSSNLKNIDAINGSKSNEFHINNNDSFISNGICHINHFPMKIAPS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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