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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004235`

染色体: Chr05 坐标: 56168533-56169363 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004235`
名称	SmilChr05G004235
描述	uncharacterized SmilChr05G004235
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	56168533 - 56169363 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026163`
GeneID	`131026163`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026163`
原始查询	`SmilChr05G004235`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G25270` (AT3G25270) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121] identity=24.7; qcov=0.572; evalue=6.73e-08; confidence=weak
Rice	`Os02g0118800` - identity=26; qcov=0.71; evalue=3.41e-12; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026163

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057811915.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057811915.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057811915.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057811915.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811915.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:56168558`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr5:56168560`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	15	B120,B13,B27,B67,B78,B83,C13,C21,C3,C37,C39,C45,C76,C82,D8
`Chr5:56168584`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B35
`Chr5:56168584`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr5:56168589`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	65	A25,A6,A7,A9,B107,B108,B111,B112,B119,B122,B126,B127,B129,B132,B133,B137,B140,B22,B25,B26,B3,B32,B4,B46,B49,B5,B52,B54,B55,B56,B58,B6,B68,B72,B78,B79,B80,B81,B86,B96,C1,C15,C18,C2,C25,C26,C30,C36,C38,C43,C46,C47,C50,C51,C53,C57,C64,C66,C67,C74,C78,C81,C83,D3,D7
`Chr5:56168593`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr5:56168616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B64,C47
`Chr5:56168620`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr5:56168625`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:56168627`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B80
`Chr5:56168627`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr5:56168651`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811915.1

276 aa

138

276

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 80-172 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811915.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	80	172	3.4e-17	63.6	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955932.1
ATGGATTATATGTTATTTTGTGATGGATTATTTTCGCTGAGTTCAGATCAACAGGGGTTGGTCGGAGAGTTTGGGAAACGGGTGGGAGAGGAGTGGAATTGGGAGTTCAGGTGGAGAAGAGATTTGCGTGAGAGGGAGATTGGGATGGTTAACAATATGTTGCTGGTTATCTCTACTTTGGCTCCTCGTGCAGGAAAGAAGGATGGATGGAAATGGAAAGCAGCAAAAGATGGAGTTTTCTCAACCAAGTCGGCATATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026163
ATGGATTATATGTTATTTTGTGATGGATTATTTTCGCTGAGTTCAGATCAACAGGGGTTGGTCGGAGAGTTTGGGAAACGGGTGGGAGAGGAGTGGAATTGGGAGTTCAGGTGGAGAAGAGATTTGCGTGAGAGGGAGATTGGGATGGTTAACAATATGTTGCTGGTTATCTCTACTTTGGCTCCTCGTGCAGGAAAGAAGGATGGATGGAAATGGAAAGCAGCAAAAGATGGAGTTTTCTCAACCAAGTCGGCATATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811915.1
MDYMLFCDGLFSLSSDQQGLVGEFGKRVGEEWNWEFRWRRDLREREIGMVNNMLLVISTLAPRAGKKDGWKWKAAKDGVFSTKSAYEAISKEKGEMASTHHEVLAQVWEAPTPHKARVVAWRSLRNRLATCDNLVKTNVPIKVEEKWCNACVCHEETVEHMFLHCPKAEQIWDQIQQWLNIKTAKPQGLSQHFLSFTHGGKGKKSRKFLKALWVGTIWLLWNYRNESRFEGKACDTQKLVLDVKGRLWSWNKTFQIVEVN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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