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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004239`

染色体: Chr05 坐标: 56209447-56214651 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004239`
名称	SmilChr05G004239
描述	polygalacturonase-1 non-catalytic subunit beta-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	56209447 - 56214651 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025286`
GeneID	`131025286`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025286`
原始查询	`SmilChr05G004239`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polygalacturonase-1 non-catalytic subunit beta-like
产物	polygalacturonase-1 non-catalytic subunit beta-like
Arabidopsis	`AT1G70370` (PG2) polygalacturonase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843373] identity=56.4; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0380100` (OsBURP12) - identity=49.8; qcov=0.959; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03181 (BURP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025286

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.80000	`XP_057810976.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057810976.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810976.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810976.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810976.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:56212256`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B7,C83
`Chr5:56212296`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr5:56212334`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,C60
`Chr5:56212335`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr5:56212363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:56212407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:56212412`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr5:56212415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr5:56212434`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B64,B84,C47
`Chr5:56212526`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B10,B63,B93
`Chr5:56212552`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A15,B21
`Chr5:56212552`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,B21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810976.1

634 aa

317

634

BURP

PF03181 BURP 419-631 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810976.1`	Pfam	`PF03181`	BURP	Family	419	631	9.4e-65	218.9	BURP domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954993.1
CCACTATAAAAAACTACCATTTCCAACCAAAAACCGACCCCCTAACTTTCTCACTCCTCTCCCTCTCTCTCTCTAGAAATATGCACTCCTCCGCCGCACCTCCCCTTCTCTGCCGCCTCGGCCTCCTCCTCCTCCTTCAATCTCTTCCACCTCTCAATGTGGCGACCGCCGCCGCCGCTGCCGCCGGAGAAAACCCGTTCACTCCGAAGAGCTACGTGATCCGTTATTGGAAAAACCACATCTCCAACGACCTGCCGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025286
ATGCACTCCTCCGCCGCACCTCCCCTTCTCTGCCGCCTCGGCCTCCTCCTCCTCCTTCAATCTCTTCCACCTCTCAATGTGGCGACCGCCGCCGCCGCTGCCGCCGGAGAAAACCCGTTCACTCCGAAGAGCTACGTGATCCGTTATTGGAAAAACCACATCTCCAACGACCTGCCGAAGCCCTCCTTCTTGCTCGACAAGGCGTCGCCGCTCACCGCGGCGGAGTTCGCCGCCTTCTCCAAGCTCGCCGGCGACCCGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810976.1
MHSSAAPPLLCRLGLLLLLQSLPPLNVATAAAAAAGENPFTPKSYVIRYWKNHISNDLPKPSFLLDKASPLTAAEFAAFSKLAGDPISLSARLRDFCLRANLFCFPDSPPPSVQKYSDNVNFTSYVGMNFTNYGGDRIGSADSFVSYSDETNLATDNFRRYGRDSAAHTEAFASYGTDVNRPDHSFAGYGGGATGGGGKFTNYQADVNMPSLRFTAYSDSGNGRAQAFAEYSKNANSGSEGFTSYGKNGNGAANEFRNYG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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