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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004250`

染色体: Chr05 坐标: 56292600-56295993 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004250`
名称	SmilChr05G004250
描述	1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA synthase, peroxisomal-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	56292600 - 56295993 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025297`
GeneID	`131025297`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025297`
原始查询	`SmilChr05G004250`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA synthase, peroxisomal-like
产物	1%2C4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA synthase%2C peroxisomal-like
Arabidopsis	`AT1G60550` (ECHID) enoyl-CoA hydratase/isomerase D [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842350] identity=74.9; qcov=0.979; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0662700` - identity=79.7; qcov=0.871; evalue=3.03e-180; confidence=high
GO	GO:0005829 (cytosol); GO:0008935 (1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA synthase activity); GO:0009234 (menaquinone biosynthetic process)
KEGG	smil00130 (Ubiquinone and other terpenoid-quinone biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00378 (ECH_1); PF16113 (ECH_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025297

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057810990.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057810990.1`
3	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057810990.1`
4	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057810990.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810990.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:56292790`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C46
`Chr5:56292806`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr5:56293873`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B28,C64,C66,C72,C74
`Chr5:56294244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,C73,D10
`Chr5:56295756`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B42,B43,B57,C26
`Chr5:56295843`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,B77
`Chr5:56295903`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810990.1

334 aa

167

334

ECH_1

ECH_2

PF00378 ECH_1 82-328 aa PF16113 ECH_2 85-261 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810990.1`	Pfam	`PF00378`	ECH_1	Domain	82	328	6.9e-75	252.3	Enoyl-CoA hydratase/isomerase
`XP_057810990.1`	Pfam	`PF16113`	ECH_2	Domain	85	261	4.7e-21	76.4	Enoyl-CoA hydratase/isomerase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955007.1
CTTATCTGCTACTCTGCCAATTCTCAAACGGAAATCATCATCAATGGCGGGAATTCGCGCAGAAGCTGCTGCAGCAATCAATAGAAGAATGTTTGCTGTTTCTAGGCATCTCAATCCGGAATCGAATCACGCTCACGGCGTCGGCATGTCCGCCTGCAGCTCCGGATTCGACGACACCTACCACCGGGTGCACGGCGCCGTGCCCACTCATATCCCGCCGTGGAAGGCGGCGATGGACGATTCCGGCAAGGATTTCGCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025297
ATGGCGGGAATTCGCGCAGAAGCTGCTGCAGCAATCAATAGAAGAATGTTTGCTGTTTCTAGGCATCTCAATCCGGAATCGAATCACGCTCACGGCGTCGGCATGTCCGCCTGCAGCTCCGGATTCGACGACACCTACCACCGGGTGCACGGCGCCGTGCCCACTCATATCCCGCCGTGGAAGGCGGCGATGGACGATTCCGGCAAGGATTTCGCCGACATTATCTACGAGAAGGCAGTCGGTGATGGCATTGCTAAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810990.1
MAGIRAEAAAAINRRMFAVSRHLNPESNHAHGVGMSACSSGFDDTYHRVHGAVPTHIPPWKAAMDDSGKDFADIIYEKAVGDGIAKITINRPERRNAFRPETVKELMRAFNDARDDNSIGVIILTGKGTKAFCSGGDQSLRGKDGYIDNDNVGRLNVLDLQVQIRRLPKPVVAMVAGYAVGGGHVLHMVCDLTIAADNAVFGQTGPKVGSFDAGYGASIMSRLVGPKRAREMWYMTRFYNAGEAEKMGLVNTVVPLEKLE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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