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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004251`

染色体: Chr05 坐标: 56303333-56307580 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004251`
名称	SmilChr05G004251
描述	polygalacturonase At1g48100-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	56303333 - 56307580 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025298`
GeneID	`131025298`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025298`
原始查询	`SmilChr05G004251`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polygalacturonase At1g48100-like
产物	polygalacturonase At1g48100-like
Arabidopsis	`AT1G60590` (AT1G60590) Pectin lyase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842353] identity=59.4; qcov=1.06; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0636500` (OsPGL19) - identity=56.4; qcov=1.06; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004650 (polygalacturonase activity); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00295 (Glyco_hydro_28)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025298

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057810991.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057810991.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810991.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810991.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810991.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:56303642`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr5:56303661`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B48,B77,C30
`Chr5:56303688`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:56303768`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr5:56303856`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,B77
`Chr5:56303868`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,B73
`Chr5:56303938`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C72,D10
`Chr5:56303964`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C72,D11
`Chr5:56304254`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr5:56304972`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B140
`Chr5:56305129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B105,B127
`Chr5:56305708`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810991.1

508 aa

254

508

Glyco_hydro_28

PF00295 Glyco_hydro_28 124-204 aa PF00295 Glyco_hydro_28 242-460 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810991.1`	Pfam	`PF00295`	Glyco_hydro_28	Repeat	124	204	1.7e-80	271.3	Glycosyl hydrolases family 28
`XP_057810991.1`	Pfam	`PF00295`	Glyco_hydro_28	Repeat	242	460	1.7e-80	271.3	Glycosyl hydrolases family 28

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955008.1
TTTGTTCATGGCCTCAAACAGTTGGTCACACACCACCTATATAATAACCATAAAGCCCACCCCCTCCTCTCTCCCCTTCCACCACCACCACTCCCGCCGCCGCCGCCGCCGGAAAAATGGGTGGTTTTTGCCTCAAGAAAATCACATTCACGATCGTCGTCGTGCTTCTCGTGTGGTGCTCCGACGTCGACACTTGCAATGCAAGAAGAGCTGGCAAGCACTGGCGGCGGAGTCAGAACTCCGCCGCCTCGCTGTCCAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025298
ATGGGTGGTTTTTGCCTCAAGAAAATCACATTCACGATCGTCGTCGTGCTTCTCGTGTGGTGCTCCGACGTCGACACTTGCAATGCAAGAAGAGCTGGCAAGCACTGGCGGCGGAGTCAGAACTCCGCCGCCTCGCTGTCCAAGAAGAAAGGCCGGAGCCACAGCTCCGGCCACCGCAATGCCGGCAAACCGAAACCGAAGACTCCTCCTCCGCCGCCGCCGCCCACAATTCCGCCGCCCAAGAAAGGTGGTGGGAATGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810991.1
MGGFCLKKITFTIVVVLLVWCSDVDTCNARRAGKHWRRSQNSAASLSKKKGRSHSSGHRNAGKPKPKTPPPPPPPTIPPPKKGGGNAAGSTVFNVLNFGAKGDGKSDDTKAFQAAWAAACKVEASIINVPEKYVFLVGPISFSGPYCQHDIVFQLDGTIVAPTGSSHWGSGLLQWLEFTKLVGLTIKGSGVIDGNGAVWWQSVDDHDPFDDQAKLIFPTNLTFGQKPPAPVSSSLGGKMPSIKPTALRFYGSFNVTVSGI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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