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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004261`

染色体: Chr05 坐标: 56407313-56408989 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004261`
名称	SmilChr05G004261
描述	60S ribosomal protein L18a-2-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	56407313 - 56408989 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025309`
GeneID	`131025309`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025309`
原始查询	`SmilChr05G004261`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L18a-2-like
产物	60S ribosomal protein L18a-2-like
Arabidopsis	`AT2G34480` (AT2G34480) Ribosomal protein L18ae/LX family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818011] identity=89.9; qcov=1; evalue=1.11e-119; confidence=high
Rice	`Os05g0565000` - identity=89.3; qcov=1; evalue=1.47e-118; confidence=high
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01775 (Ribosomal_L18A)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025309

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811021.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057811021.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811021.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811021.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811021.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:56407469`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:56407654`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr5:56407656`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	48	A11,A18,A19,A2,A21,A25,A7,B100,B104,B109,B113,B117,B123,B128,B129,B132,B136,B24,B29,B33,B49,B52,B53,B55,B62,B63,B67,B74,B78,B82,B88,C15,C17,C22,C23,C26,C3,C31,C37,C46,C47,C52,C53,C55,C57,C71,C75,D6
`Chr5:56407658`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	A11,A7,B128,B52,B62,B78,B82,B88,C21,C22,C3,C53,C57,D6
`Chr5:56408497`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr5:56408550`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B56,B60,B96
`Chr5:56408562`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B104
`Chr5:56408562`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B104
`Chr5:56408581`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,B65
`Chr5:56408586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B25,B65,C13,C50
`Chr5:56408626`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B19,C10,C63
`Chr5:56408626`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B19,C10,C63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811021.1

178 aa

178

Ribosomal_L18A

PF01775 Ribosomal_L18A 7-128 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811021.1`	Pfam	`PF01775`	Ribosomal_L18A	Domain	7	128	1.7e-23	83.3	Ribosomal proteins 50S-L18Ae/60S-L20/60S-L18A

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955038.1
AGAGCCCACAACGCATTGGGCCGGTACCACTAGAAGCCCATCCATCTGCAACGATTTCCTAAAATCCAATTTCATCACAAAACCCTAATTTCTCGCCCATTTCCCTCCCACATCCGCCAACGGAGCGAGGAGAGTGGCAGAAATGGTGAATTACAGGTTCCATCAGTACCAGGTGGTGGGCAGAGCTCTGCCGACGGAGGCGGAGCAGCACCCGAAGATTTACCGTATGAAGCTCTGGGCTACCAATGAAGTCCGCGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025309
ATGGTGAATTACAGGTTCCATCAGTACCAGGTGGTGGGCAGAGCTCTGCCGACGGAGGCGGAGCAGCACCCGAAGATTTACCGTATGAAGCTCTGGGCTACCAATGAAGTCCGCGCCAAGTCCAAATTCTGGTATTTCTTGAGGAAACTCAAGAAGGTGAAGAAGAGCAATGGCCAGGTTCTTGCTATTAATGAGATATTCGAGAAGAATCCAACCACAATCAAGAACTTCGGCATATGGCTACGATACCAAAGTAGGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811021.1
MVNYRFHQYQVVGRALPTEAEQHPKIYRMKLWATNEVRAKSKFWYFLRKLKKVKKSNGQVLAINEIFEKNPTTIKNFGIWLRYQSRTGYHNMYKEYRDTTLNGGVEQMYTEMASRHRVRHHCIQIIKTATVPAKLCKRECTKQFHDSKIKFPLVYRKVRPPTRKLKTTYKATRPNLFM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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