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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004262`

染色体: Chr05 坐标: 56410434-56413275 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004262`
名称	SmilChr05G004262
描述	polygalacturonase At1g48100
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	56410434 - 56413275 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025310`
GeneID	`131025310`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025310`
原始查询	`SmilChr05G004262`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polygalacturonase At1g48100
产物	polygalacturonase At1g48100
Arabidopsis	`AT3G26610` (AT3G26610) Pectin lyase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822270] identity=58.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0636500` (OsPGL19) - identity=47.7; qcov=0.891; evalue=3.01e-134; confidence=high
GO	GO:0004650 (polygalacturonase activity); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	smil00040 (Pentose and glucuronate interconversions - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00295 (Glyco_hydro_28)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025310

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057811022.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057811022.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811022.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811022.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811022.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:56410489`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B135,B18,B56,B60,B96
`Chr5:56410549`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B10
`Chr5:56410569`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,B8
`Chr5:56410650`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B91,B94
`Chr5:56410650`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B91,B94
`Chr5:56410662`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B19,C10,C63
`Chr5:56410671`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr5:56410693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,C37
`Chr5:56410866`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr5:56410898`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr5:56410957`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr5:56411088`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811022.1

466 aa

233

466

Glyco_hydro_28

PF00295 Glyco_hydro_28 106-417 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811022.1`	Pfam	`PF00295`	Glyco_hydro_28	Repeat	106	417	6.9e-83	279.1	Glycosyl hydrolases family 28

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955039.1
ATTGCAAAAAAGAAAGTTCAGATTGAAAGATGAAGAGAGCCCAAAAAACCTCCTCCCTTCTACTCCTCCTTGTCCTCTGCCTTCTCATCTTAGCTGCATTCTCCAAAATCGAGGCGCGAAAACACCATGGAAAGAGGATCAAAATGCACAAGCACAAGAGGAGCAAAAATGGTGATGCATCTCTTGCTCCTGCACCAGCTCCACTGCCTGACTCCGGCCCGGGCCCCTCAAAATCGCCCGTGTTCAACATCTTGTCGTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025310
ATGAAGAGAGCCCAAAAAACCTCCTCCCTTCTACTCCTCCTTGTCCTCTGCCTTCTCATCTTAGCTGCATTCTCCAAAATCGAGGCGCGAAAACACCATGGAAAGAGGATCAAAATGCACAAGCACAAGAGGAGCAAAAATGGTGATGCATCTCTTGCTCCTGCACCAGCTCCACTGCCTGACTCCGGCCCGGGCCCCTCAAAATCGCCCGTGTTCAACATCTTGTCGTTCGGAGCTAGGGCTAACGGAGTCTCCGACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811022.1
MKRAQKTSSLLLLLVLCLLILAAFSKIEARKHHGKRIKMHKHKRSKNGDASLAPAPAPLPDSGPGPSKSPVFNILSFGARANGVSDDSKALLEAWKSACKVAGGVVEIPVGLEFLIKPLTLQGPCRPNLVLQIDGTLLAPRKIGSWPESSLYQWMNFKWLQNFTIQGGGTVDGQGSNWWASSQPNQKKKAKRIPDIKPTALRFYKSYDITVVDVRIINSPLCHLKFDNSKRVKVKNVTISAPQDSPNTDGIHLQNSQDVE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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