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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004263`

染色体: Chr05 坐标: 56414854-56417874 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004263`
名称	SmilChr05G004263
描述	high affinity nitrate transporter 2.5-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	56414854 - 56417874 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025311`
GeneID	`131025311`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025311`
原始查询	`SmilChr05G004263`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	high affinity nitrate transporter 2.5-like
产物	high affinity nitrate transporter 2.5-like
Arabidopsis	`AT1G12940` (NRT2.5) nitrate transporter2.5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837852] identity=71.5; qcov=0.948; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0704100` (NRT2.3) - identity=67.4; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0015112 (nitrate transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	smil00910 (Nitrogen metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF07690 (MFS_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025311

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057811023.1`
2	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057811023.1`
3	Secretory vesicle	Secretory vesicle	0.20000	`XP_057811023.1`
4	Synaptic vesicle	Synaptic vesicle	0.20000	`XP_057811023.1`
5	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057811023.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:56414952`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	34	A14,A18,B103,B105,B115,B122,B124,B134,B21,B22,B29,B30,B38,B39,B48,B5,B50,B51,B57,B71,B75,B84,C24,C29,C33,C35,C37,C42,C49,C55,C6,C76,C9,D8
`Chr5:56415207`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:56415242`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,B31,C73
`Chr5:56416562`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr5:56416584`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C30
`Chr5:56416584`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C30
`Chr5:56416607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr5:56416742`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,B72
`Chr5:56416795`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:56416892`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B92
`Chr5:56416892`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B92
`Chr5:56416898`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811023.1

503 aa

252

503

MFS_1

PF07690 MFS_1 43-399 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811023.1`	Pfam	`PF07690`	MFS_1	Family	43	399	6.8e-20	72.0	Major Facilitator Superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955040.1
AAATGAAATCGACGGTGCATATCAATATTTGATATAAGGCCAATCCAAGATATTAATTTTCCTCTTAAACAAAAAGTATACATAAAAATTAGAGTTTGGCGGTTTAGGAAATTAAAAATACATATATATGTTAGAGTATATATATAGTGTGTGTGTGTGTGTCCCTGGTCGAATCGTGTAACTAATTAGTTGTGCAATCAAAGTCTCCAAATTAAAGAATGGAGATTCCCGTGGAAGAAGAATCTCCAAAGAGATTCTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025311
ATGGAGATTCCCGTGGAAGAAGAATCTCCAAAGAGATTCTCCCTCCCCGTAGATTCCGAGCACAAGGCCACCGAATTCCGCCTGTTCTCGGCGGCGGCGCCGCACATGCGCGCGTTCCACCTCTCGTGGATCTCCTTCTTCACGTGCTTCGTCTCCACCTTCGCCGCGCCGCCCCTCCTCCCCGTCATCCGCGACGACCTTAACCTCACCGCCACCGACATCGGCAACGCCGGCATCGCCGCCGTCTCCGGCGCCGTCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811023.1
MEIPVEEESPKRFSLPVDSEHKATEFRLFSAAAPHMRAFHLSWISFFTCFVSTFAAPPLLPVIRDDLNLTATDIGNAGIAAVSGAVFARIAMGTACDLFGPRLASAALILATAPAVFCTPLAASPASFLLLRFLTGFSLATFVSTQFWMSSLFSPTVVATANGVAGGWGNLGGGATQLIMPLVFDLIVTAGAGKFTAWRAAFFVPGLLQALSAYGIFFLGQDLPDGDYAQLQKSGDKHKDSFGKILSCAGANYRGWILAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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