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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004268`

染色体: Chr05 坐标: 56464607-56467849 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004268`
名称	SmilChr05G004268
描述	tryptophan aminotransferase-related protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	56464607 - 56467849 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025318`
GeneID	`131025318`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025318`
原始查询	`SmilChr05G004268`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tryptophan aminotransferase-related protein 1-like
产物	tryptophan aminotransferase-related protein 1-like
Arabidopsis	`AT4G24670` (TAR2) tryptophan aminotransferase related 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828569] identity=54.1; qcov=0.873; evalue=4.92e-132; confidence=high
Rice	`Os05g0169300` (TAR1) - identity=51; qcov=0.897; evalue=1.97e-128; confidence=high
GO	GO:0006520 (amino acid metabolic process); GO:0008483 (transaminase activity); GO:0016846 (carbon-sulfur lyase activity)
KEGG	smil00380 (Tryptophan metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00155 (Aminotran_1_2); PF04864 (Alliinase_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025318

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057811030.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057811030.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057811030.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811030.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811030.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:56464737`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,B100
`Chr5:56464743`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr5:56465861`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C38,C5,C65
`Chr5:56465877`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C7
`Chr5:56465877`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C7
`Chr5:56465945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,C46
`Chr5:56466953`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B138
`Chr5:56466953`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B138
`Chr5:56466980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B95,C28,C39,C53
`Chr5:56467050`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B15,B79,B91,D4
`Chr5:56467062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B47,B95,C28,C39,C53
`Chr5:56467327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811030.1

409 aa

204

409

Alliinase_C

Aminotran_1_2

PF04864 Alliinase_C 52-403 aa PF00155 Aminotran_1_2 97-400 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811030.1`	Pfam	`PF04864`	Alliinase_C	Domain	52	403	5.6e-133	444.0	Allinase
`XP_057811030.1`	Pfam	`PF00155`	Aminotran_1_2	Domain	97	400	4.8e-13	49.8	Aminotransferase class I and II

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955047.1
ATTAAACCTCTTCAAAAAAAAAAAAAGGAAGAAAAAAAATTAAAAGGAGGAAAAATGGGGAGTGTAGAAGGCGCAGTTGTGATGGAAAGCAACATGAATGCAGCTGTTGCTGCTGCAGCTGCTGCTTCTGCTGCTGCAGATGTTGAAGAAAGAAACAATGATGAGTCCATGATCACAAACCTTCACCTTCACTCCATTCCCACTCTCAATCTTGATCAGGGTGATCCCACAGTGTACGAGGCCTACTGGAAATCAGTAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025318
ATGGGGAGTGTAGAAGGCGCAGTTGTGATGGAAAGCAACATGAATGCAGCTGTTGCTGCTGCAGCTGCTGCTTCTGCTGCTGCAGATGTTGAAGAAAGAAACAATGATGAGTCCATGATCACAAACCTTCACCTTCACTCCATTCCCACTCTCAATCTTGATCAGGGTGATCCCACAGTGTACGAGGCCTACTGGAAATCAGTAGGCGAAAACGTGAAGATTAGCATCTCTGCATCACAATCCCTCAGCTACTTCGCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811030.1
MGSVEGAVVMESNMNAAVAAAAAASAAADVEERNNDESMITNLHLHSIPTLNLDQGDPTVYEAYWKSVGENVKISISASQSLSYFANPNSFCWFLVPKLEQEIKILHSLVGNAVVDGRHIVVGNGSSQLIQAALYALADPLDPPTPITVVSAVPFYSCYPQITDYVRSGLYKWGGDANAYDKDEAYIELVTSPNNPDGEIRGPVVKRANGMLLHDLAYYWPQYTAITAPADHDVMLFTLSKCTGHAGSRIGWAVVKDAEV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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